| 华北大黑鳃金龟气味结合蛋白HoblOBP2的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 庄绪静,尹姣,李克斌,曹雅忠.华北大黑鳃金龟气味结合蛋白HoblOBP2的生物信息学分析[J].植物保护,2013,39(1):50-55. |
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| 作者姓名： | 庄绪静 尹姣 李克斌 曹雅忠 |
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| 作者单位： | 中国农业科学院植物保护研究所,北京,100193 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31000853);公益性行业(农业)科研专项经费(201003025) |
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| 摘 要： | 探讨应用生物信息学技术预测华北大黑鳃金龟触角气味结合蛋白HoblOBP2三维结构及其与苯甲酸己酯的结合模式.利用生物信息学相关工具和网站预测HoblOBP2的基本性质,并对其三维结构进行同源建模后发现HoblOBP2的三维结构具有与昆虫普通气味结合蛋白结构的共同特点,即6个α螺旋,其中除了α2在外的5个α螺旋形成疏水结合口袋,3对二硫键起着稳定蛋白结构的作用.将苯甲酸己酯分子对接到HoblOBP2的活性区域,预测蛋白质与气味分子的结合模式,经分析可知蛋白质与气味分子主要通过范德华力和疏水作用相互影响,蛋白内部形成分子内氢键,根据蛋白与气味分子间的结合特性推测HoblOBP2与气味分子结合的三个关键结合位点分别为:LEU73,THR54和VAL137.
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| 关 键 词： | 气味结合蛋白 生物信息学 同源建模 分子对接 |
Bioinformatics analysis of the odorant-binding protein HoblOBP2 in olfactory sensilla of the scarab beetle Holotrichia oblita |
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| Zhuang Xujing,Yin Jiao,Li Kebin,Cao Yazhong.Bioinformatics analysis of the odorant-binding protein HoblOBP2 in olfactory sensilla of the scarab beetle Holotrichia oblita[J].Plant Protection,2013,39(1):50-55. |
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| Authors: | Zhuang Xujing Yin Jiao Li Kebin Cao Yazhong |
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| Institution: | (Institute of Plant Protection,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing 100193,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | odorant binding protein bioinformatic homology modeling molecular docking |
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