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正交设计优化大豆SSR-PCR反应体系及引物筛选
引用本文:苏辉,李志刚,宋书宏. 正交设计优化大豆SSR-PCR反应体系及引物筛选[J]. 华北农学报, 2009, 24(2)
作者姓名:苏辉  李志刚  宋书宏
作者单位:1. 内蒙古民族大学,农学院,内蒙古,通辽,028042
2. 辽宁省农业科学院,辽宁,沈阳,110161
基金项目:内蒙古教育厅资助项目 
摘    要:
以大豆(Glycine max L.)为材料,研究了PCR反应体系的主要成分对大豆SSR扩增结果的影响,并确定影响SSR扩增结果的各因素的最佳用量.以CTAB法提取的大豆叶片DNA为模板,应用L16(44)正交设计对影响大豆SSR-PCR的主要参数进行优化,建立适合大豆SSR-PCR反应的最佳体系.结果表明:各因素不同水平浓度对PCR反应结果均有显著影响.大豆SSR-PCR优化反应体系为:2.0 μL 10×PCR Buffer,30 ng模板DNA,150μmol/L dNTP,0.4 μmol/LSSR引物,1.5 U Taq DNA聚合酶,2.0 mmoL/L Mg2+,加ddH2O至终体积20.0μL.优化的PCR扩增程序为:94℃预变性5 min.94℃变性30 s,50℃退火1 min,72℃延伸1 min,共35个循环,72℃延伸5 min,4℃保存.同时选用200对大豆引物对2份材料进行扩增,筛选出条带清晰,多态性好的引物74对,用于大豆SSR标记的进一步研究.

关 键 词:大豆  正交设计  体系优化  引物筛选

Optimization of SSR-PCR System on Soybean by Orthogonal Design and SSR Primer Selection
SU Hui,LI Zhi-gang,SONG Shu-hong. Optimization of SSR-PCR System on Soybean by Orthogonal Design and SSR Primer Selection[J]. Acta Agriculturae Boreali-Sinica, 2009, 24(2)
Authors:SU Hui  LI Zhi-gang  SONG Shu-hong
Affiliation:1.College of Agronomy;Inner Mongolia University for Nationalities;Tongliao 028042;China;2.Liaoning Academy of Agriculture Sciences;Shenyang 110161;China
Abstract:
Keywords:SSR-PCR
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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