草鱼基因组中微卫星分子标记的制备及筛选 |
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作者姓名: | 马海涛 鲁翠云 于冬梅 孙效文 |
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作者单位: | 中国水产科学研究院,黑龙江水产研究所,黑龙江,哈尔滨,150070;大连水产学院,辽宁,大连,116023;中国水产科学研究院,黑龙江水产研究所,黑龙江,哈尔滨,150070 |
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基金项目: | 国家重点基础研究发展计划(973计划);国家公益性计划 |
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摘 要: | 采用新型的生物素-磁珠吸附微卫星富集法与传统的放射性同位素杂交法相结合的方式,研究了草鱼(Ctenopharyngodon idella)基因组中存在的微卫星资源.结果,从1 000个细菌中,挑出90个阳性克隆,把其中45个进行测序分析,在这些序列中共含有68个微卫星核心序列,有55个含有重复次数大于5次的微卫星核心序列.其中,单一型标记49个,占72%,包括CA重复单元共22个,GT重复单元共18个,其他重复单元为9个;在72%的单一型标记中,完美单一型微卫星标记为44个,占65%.另外,混合型标记共19个,13为完美混合型;在所有微卫星标记中,CA重复类型最普遍,依次为GT、GA等.在68个微卫星标记中,有15个依据引物设计原理设计了引物.
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关 键 词: | 草鱼 生物素 磁珠 微卫星 |
修稿时间: | 2006-07-10 |
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