| 团头鲂微卫星标记的快速制备 |
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| 引用本文： | 李绍戊,常玉梅,梁利群,孙效文. 团头鲂微卫星标记的快速制备[J]. 中国水产科学, 2006, 13(2): 187-192 |
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| 作者姓名： | 李绍戊 常玉梅 梁利群 孙效文 |
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| 作者单位： | 1. 中国水产科学研究院,黑龙江水产研究所,黑龙江,哈尔滨,150070;上海水产大学,生命科学与技术学院,上海,200090
2. 中国水产科学研究院,黑龙江水产研究所,黑龙江,哈尔滨,150070 |
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| 摘 要： | 采用磁珠富集法与放射性杂交相结合开发团头鲂（Megalobrama amblycephala）基因组微卫星资源。以团头鲂基因组DNA为材料，经Sau 3AⅠ限制性内切酶消化后，选取400～900bp的片段进行PCR全基因组扩增，并利用生物素标记的（CA）15探针进行微卫星片段的富集。将得到的片段与T载体连接后转入DH5α大肠杆菌中，然后利用γ-32P标记的放射性同位素探针进行第二轮杂交。结果表明，共获得微卫星基因组文库2000个菌，杂交前菌落PCR检测阳性克隆率为50％；杂交后得到的阳性克隆为230个，占11．5％。从得到的230个阳性克隆中挑出120个进行测序，有94个克隆含有重复次数大于5次的微卫星序列，其中46个（48．94％）有随机侧翼区，可以设计引物；14个缺乏足够的侧翼序列。在得到的微卫星序列中，重复单元除CA／GT外，还观察到CT、AG、CG、CAA、CTCA等重复单元。在单一型标记中，完美础占53．15％，非完美型为37．84％；混合型标记占9．01％。另外，微卫星重复次数主要集中在5-30次，占75．68％。本研究旨在对团头鲂基因组资源的开发利用起到一定的促进作用，并为团头鲂养殖品系的优化、遗传多样性的检测及遗传图谱的构建等奠定基础。
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| 关 键 词： | 团头鲂 微卫星 磁珠富集 |
| 文章编号： | 1005-8737（2006）02-0187-06 |
| 收稿时间： | 2005-07-14 |
| 修稿时间： | 2005-10-24 |
Rapid isolation of microsatellites from genome of Bluntnose black bream (Megalobrama amblycephala ) |
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| LI Shao-wu,CHANG Yu-mei,LIANG Li-qun,SUN Xiao-wen. Rapid isolation of microsatellites from genome of Bluntnose black bream (Megalobrama amblycephala )[J]. Journal of Fishery Sciences of China, 2006, 13(2): 187-192 |
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| Authors: | LI Shao-wu CHANG Yu-mei LIANG Li-qun SUN Xiao-wen |
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| Affiliation: | 1.Heiiongjiang River Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Harbin 150070, China; 2. School of Life Science and Technology, Shanghai Fisheries University, Shanghai 200090, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Megalobrarna amblycephala microsatellitc magneticbeads enrichment |
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