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虉草ISSR-PCR反应体系优化与引物筛选
引用本文:张永亮,刘鹏,骆秀梅,刘杨.虉草ISSR-PCR反应体系优化与引物筛选[J].草原与草坪,2016(3).
作者姓名:张永亮  刘鹏  骆秀梅  刘杨
作者单位:内蒙古民族大学,内蒙古通辽,028042
基金项目:内蒙古自然科学基金(2015MS0337),内蒙古民族大学市校合作项目(SXYB2012077)
摘    要:22个虉草基因组DNA为ISSR-PCR扩增模板,采用单因素试验方法,对影响PCR扩增体系中dNTP、引物浓度、Taq酶和模板DNA用量4个因素及引物退火温度进行梯度试验,优化得到最佳的ISSR-PCR反应体系,即20μL反应体系中分别加入0.3μL Taq DNA聚合酶(5U/μL),2μL 10×PCR Buffer(mg2+plus),1.5μL dNTP(2.5mmol/L),1.5μL引物(10pmol/μL),50ng模板DNA,ddH2O补足体积。以此体系对24条引物进行筛选,最终获得了多态性高,重复性好的引物12条。引物UBC808、809、811、815、818、820、826的适宜退火温度为55℃,引物835,841和842的适宜退火温度为56℃,而引物810和834的适且退火温度分别为52℃和54℃。12条引物共扩增总条带数192条,其中,多态性条带数173条,多态位点百分率89.81%。

关 键 词:虉草  ISSR-PCR反应体系  引物筛选

Optimization of ISSR-PCR reaction system and primer selection for Phalaris arundinacea
ZHANG Yong-liang,LIU Peng,LUO Xiu-mei,LIU Yang.Optimization of ISSR-PCR reaction system and primer selection for Phalaris arundinacea[J].Grassland and Turf,2016(3).
Authors:ZHANG Yong-liang  LIU Peng  LUO Xiu-mei  LIU Yang
Abstract:
Keywords:Phalaris arundinacea  ISSR-PCR reaction system  primer selection
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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