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红麻EST-SSR标记的开发及其多态性评价
引用本文:万雪贝,李东旭,徐益,徐建堂,张力岚,张列梅,林荔辉,祁建民,张立武.红麻EST-SSR标记的开发及其多态性评价[J].作物学报,2017,43(8):1170-1180.
作者姓名:万雪贝  李东旭  徐益  徐建堂  张力岚  张列梅  林荔辉  祁建民  张立武
作者单位:1福建农林大学作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室 / 福建省作物设计育种重点实验室 / 作物科学学院; 2福建农林大学海峡联合研究院基因组与生物技术中心, 福建福州 350002
基金项目:本研究由福建农林大学杰出青年科研基金项目(xjq201401), 国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-19-E06), 农业部东南黄红麻实验观测站(农科教发2011), 中贝粮油及特色经济作物引育种及新品种示范推广项目(2015I0001)和福建省麻类种质资源共享平台项目(2010N2002)资助。
摘    要:红麻是最重要的自然纤维作物之一,然而SSR标记的匮乏限制了其遗传改良。本研究从红麻90 175个EST序列中挑出含有转录因子的EST,开发了94对SSR引物。以24份不同红麻种质资源的DNA为模板,利用9%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测多态性。结果表明,85对引物(占90.4%)至少在2个材料之间存在多态性,表明开发的EST-SSR具有很好的多态性。其中,三核苷酸重复所占比例最多,重复基元AAT和ATG的多态性较高。聚类分析表明,24份红麻种质资源的遗传相似系数变化在0.62~0.92之间,表现出丰富的遗传基础。这些结果不仅丰富了红麻的分子标记数量,而且为红麻的遗传分析提供资源。

关 键 词:红麻  SSR  遗传多样性  标记开发
收稿时间:2016-07-04

Development and Polymorphism Evaluation of EST-SSR Markers in Kenaf
WAN Xue-Bei,LI Dong-Xu,XU Yi,XUJian-Tang,ZHANG Li-Lan,ZHANGLie-Mei,LINLi-Hui,QI Jian-Min,ZHANG Li-Wu.Development and Polymorphism Evaluation of EST-SSR Markers in Kenaf[J].Acta Agronomica Sinica,2017,43(8):1170-1180.
Authors:WAN Xue-Bei  LI Dong-Xu  XU Yi  XUJian-Tang  ZHANG Li-Lan  ZHANGLie-Mei  LINLi-Hui  QI Jian-Min  ZHANG Li-Wu
Institution:1.Key Laboratory for Genetics, Breeding and Multiple Utilization of Crops of Ministry of Education / Fujian Key Laboratory for Crop Breeding by Design / College of Crop Science, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002, China;2.Center for Genomics and Biotechnology, Haixia Institute of Science and Technology, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002, China
Abstract:
Keywords:Kenaf (Hibiscus cannabinus)  Simple sequence repeat  Genetic diversity  Marker development
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