| 陆地棉SRO基因家族的鉴定及表达分析 |
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| 引用本文： | 吕有军,杨卫军,赵兰杰,姚金波,陈伟,李燕,张永山.陆地棉SRO基因家族的鉴定及表达分析[J].作物学报,2017,43(10):1468-1479. |
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| 作者姓名： | 吕有军 杨卫军 赵兰杰 姚金波 陈伟 李燕 张永山 |
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| 作者单位： | 1 安阳工学院, 河南安阳 455000; 2 中国农业科学院棉花研究所, 河南安阳 455000; 3 棉花生物学国家重点实验室, 河南安阳 455000 |
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| 基金项目： | 本研究由河南省科技厅基础与前沿项目(112300410019)和棉花生物学国家重点实验室开放课题(CB2014A10)共同资助。 |
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| 摘 要： | SRO是植物特有的类RCD-ONE蛋白家族,在植物抵御各种生物和非生物胁迫过程中具有重要的作用。本研究利用生物信息学方法从陆地棉遗传标准系TM-1(Gossypium hirsutum L.acc.TM-1)基因组中鉴定到12个SRO基因家族成员。多重序列比对及进化树分析表明,12个陆地棉SRO均含有PARP和RST结构域,聚为3类,即A、B和C亚家族。转录组数据分析表明,TM-1全基因组中的Gh_D12G1442在茎中优势表达,Gh_D05G2064在萼片和雄蕊中优势表达;Gh_A05G3788在雄蕊中优势表达,Gh_A12G1318在雄蕊和纤维中优势表达;Gh_A12G2480、Gh_D12G2608、Gh_A05G2257和Gh_D05G2516在纤维中优势表达;Gh_A08G1390、Gh_D08G1685、Gh_A12G2663和Gh_D12G2054具有较为广泛的组织表达。逆境胁迫处理试验表明,Gh_A08G1390明显受冷处理和盐处理的诱导,Gh_D12G2054、Gh_D08G1685、Gh_A12G2663基因在不同的胁迫处理下受到不同程度的诱导。
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| 关 键 词： | 陆地棉 逆境胁迫 SRO 基因组 |
| 收稿时间： | 2017-01-25 |
Genome-wide Identification and Expression Analysis of SRO Genes Family in Gossypium hirsutum L. |
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| LYU You-Jun,YANG Wei-Jun,ZHAO Lan-Jie,YAO Jin-Bo,CHEN Wei,LI Yan,ZHANG Yong-Shan.Genome-wide Identification and Expression Analysis of SRO Genes Family in Gossypium hirsutum L.[J].Acta Agronomica Sinica,2017,43(10):1468-1479. |
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| Authors: | LYU You-Jun YANG Wei-Jun ZHAO Lan-Jie YAO Jin-Bo CHEN Wei LI Yan ZHANG Yong-Shan |
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| Institution: | 1.Anyang Institute of Technology, Henan Anyang 455000;2.Institute of Cotton Research, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Henan Anyang 455000;3.State Key Laboratory of Cotton Biology, Henan Anyang 455000. |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Upland cotton Abiotic stress SRO Genomics |
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