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马铃薯丝氨酸羧肽酶类蛋白StSCPL家族的鉴定及干旱胁迫响应分析
引用本文:晋昕,魏玉溪,陈正亮,王泽民,张国栋,杨江伟,张宁,司怀军.马铃薯丝氨酸羧肽酶类蛋白StSCPL家族的鉴定及干旱胁迫响应分析[J].干旱地区农业研究,2023(4):9-20.
作者姓名:晋昕  魏玉溪  陈正亮  王泽民  张国栋  杨江伟  张宁  司怀军
作者单位:省部共建干旱生境作物学国家重点实验室, 甘肃 兰州 730070; 甘肃农业大学生命科学技术学院, 甘肃 兰州 730070;忻州师范学院生物系, 山西 忻州 034099
基金项目:国家自然科学基金(32260518);省部共建干旱生境作物学国家重点实验室开放基金(GSCS-2022-03);甘肃省科技厅青年科技基金(22JR5RA882,21JR7RA844)
摘    要:在全基因组水平上鉴定了马铃薯SCPL基因家族,并对其成员的基本特征、蛋白质保守结构域、进化关系和干旱胁迫下的表达模式进行了分析。同时,以干旱耐受性不同的马铃薯品种‘陇薯10号’(干旱耐受型)和‘大西洋’(干旱敏感型)为试验材料,利用高通量测序分析了干旱胁迫关键差异表达基因StSCPLs。结果表明,马铃薯中共鉴定到了41个StSCPLs,不对称分布在11条染色体中,多数成员含有多个内含子。其蛋白均含有1个细胞内分泌和转运的信号肽、底物结合位点、N-糖基化位点以及与催化作用相关的进化保守基序。在非生物胁迫下,大多数StSCPLs都具有多胁迫响应性。在干旱耐受性不同的马铃薯品种中,StSCPLs表现出差异表达特性。同时,LncRNA及其靶StSCPL介导的调控网络显示,StSCPL3和StSCPL34分别是lncRNA MSTRG.2301.1和MSTRG.19548.1的靶基因,在干旱耐受性不同的品种中显著差异表达,可能是马铃薯对干旱胁迫响应的潜在靶点。

关 键 词:马铃薯  SCPL基因家族  鉴定  胁迫响应  LncRNA

Identification of potato serine carboxypeptidase\|like protein StSCPL family and analysis of its response to drought stress
JIN Xin,WEI Yuxi,CHEN Zhengliang,WANG Zemin,ZHANG Guodong,YANG Jiangwei,ZHANG Ning,SI Huaijun.Identification of potato serine carboxypeptidase\|like protein StSCPL family and analysis of its response to drought stress[J].Agricultural Research in the Arid Areas,2023(4):9-20.
Authors:JIN Xin  WEI Yuxi  CHEN Zhengliang  WANG Zemin  ZHANG Guodong  YANG Jiangwei  ZHANG Ning  SI Huaijun
Institution:State Key Laboratory of Aridland Crop Science, Gansu Agricultural University, Lanzhou, Gansu 730070, China; College of Life Science and Technology, Gansu Agricultural University, Lanzhou, Gansu 730070, China;Department of Biology, Xinzhou Teachers University, Xinzhou, Shanxi 034099, China
Abstract:
Keywords:potato  SCPL gene family  identification  stress response  LncRNA
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