| 香蕉TCP家族的全基因组鉴定及对低氮胁迫的响应 |
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| 引用本文： | 阚宝林,杨勇,杜鹏萌,李信平,来文杰,胡海燕. 香蕉TCP家族的全基因组鉴定及对低氮胁迫的响应[J]. 分子植物育种, 2022, 0(1) |
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| 作者姓名： | 阚宝林 杨勇 杜鹏萌 李信平 来文杰 胡海燕 |
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| 作者单位： | 海南大学热带作物学院;海南大学海南省热带生物资源可持续利用重点实验室 |
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| 基金项目： | 海南省自然科学基金高层次人才项目(320RC494);海南省研究生创新科研课题(Hys2019-132)共同资助。 |
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| 摘 要： | TCP(Teeosinte branchedⅠ,Cycloidea,Proliferating cell fatcors 1和2)是含有一个高度保守非典型的bHLH(basic-Helix-Loop-Helix)保守结构域的植物特有转录因子基因家族之一,参与调控植物生长发育和非生物胁迫响应等生理过程。为了探究香蕉(Musa acuminata)TCP基因家族对低氮胁迫的响应,本研究从全基因组的分布、蛋白质理化性质、保守结构域等生物信息学方面阐述了香蕉MaTCPs基因家族成员的基本特征,并且对香蕉叶片和根在低氮胁迫下的MaTCPs基因家族成员的表达模式进行了分析。结果表明,香蕉TCP转录因子家族共包含48个成员,可分为ClassⅠ(PCF)和ClassⅡ(CYC/TB1和CIN)两个亚家族,所有成员均定位于除Chr.09和chrUn_random以外的染色体上,且存在多个串联重复基因对。在低氮胁迫下,香蕉MaTCPs基因家族大部分基因表达量上调,且在不同的组织中表达模式不同。同一亚家族基因在根和叶中表现出一致的表达模式。这些结果表明Ma TCPs家族成员可能参与了香蕉对于低氮胁迫的响应。本研究将为香蕉低氮胁迫的机制研究和香蕉TCP转录因子家族的功能分析提供理论基础,为香蕉抗逆育种提供参考。
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| 关 键 词： | TCP基因家族 香蕉(Musa acuminata) 生物信息学 全基因组检索 共线性 |
Genome-wide Identification of Musa acuminata TCP Family and Its Response to Low Nitrogen Stress |
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| Kan Baolin,Yang Yong,Du Pengmeng,Li Xinping,Lai Wenjie,Hu Haiyan. Genome-wide Identification of Musa acuminata TCP Family and Its Response to Low Nitrogen Stress[J]. Molecular Plant Breeding, 2022, 0(1) |
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| Authors: | Kan Baolin Yang Yong Du Pengmeng Li Xinping Lai Wenjie Hu Haiyan |
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| Affiliation: | (College of Tropical Crops,Hainan University,Haikou,570228;Hainan Key Laboratory for Sustainable Utilization of Tropical Bioresource,Hainan University,Haikou,570228) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | TCP gene family Banana(Musa acuminata) Bioinformatics Genome-wide retrieval Collinearity |
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