| 禽流感病毒广东株HA 基因BLSOM神经网络分型方法的建立 |
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| 引用本文： | 田纯见,罗 琼,高佳卉,林志雄,鱼海琼,刘志玲,陈 茹,吴晓薇.禽流感病毒广东株HA 基因BLSOM神经网络分型方法的建立[J].广东农业科学,2016,43(2):156-160. |
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| 作者姓名： | 田纯见 罗 琼 高佳卉 林志雄 鱼海琼 刘志玲 陈 茹 吴晓薇 |
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| 作者单位： | 广东出入境检验检疫局检验检疫技术中心/广东省动植物与食品进出口技术措施研究重点实验室/国家质量监督与检验检疫总局国家禽流感检测重点实验室 广东,广东广州,510623 |
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| 基金项目： | 国家出入境检验检疫科研项目(2015IK054)，科技部国家重大科学仪器设备开发专项(2012YQ09019705) |
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| 摘 要： | 利用25个禽流感病毒及相关流感病毒广东株HA基因序列,建立三、四核苷酸特征基因片段BLSOM神经网络分型方法,对各片段数量进行统计和归一化处理。设计程序由MATLAB函数模拟人脑思维自组织学习,当训练步数为100及以上各毒株能成功聚类。H1、H3、H5、H7和H9亚型主要毒株分别归为一类,其中H3N2和H7N9毒株HA基因聚类图谱高度相似,表明这些毒株起源相同;不同年代H5N1毒株差异较大;H1N1和H9N2各1个毒株聚为一类,表明这两种病毒自然重组变异,为高危毒株筛查和溯源提供参考。
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| 关 键 词： | 禽流感病毒 BLSOM HA基因 神经网络 分型 |
Development of neural networks for batch-learning self-organizing map (BLSOM) clustering of hemagglutinin genes of avian influenza viruses isolated from Guangdong province |
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