| 马铃薯资源晚疫病抗性的全基因组关联分析 |
| |
| 引用本文： | 蒋伟,潘哲超,包丽仙,周福仙,李燕山,隋启君,李先平. 马铃薯资源晚疫病抗性的全基因组关联分析[J]. 作物学报, 2021, 0(2): 245-261 |
| |
| 作者姓名： | 蒋伟 潘哲超 包丽仙 周福仙 李燕山 隋启君 李先平 |
| |
| 作者单位： | 云南省农业科学院经济作物研究所;云贵高原马铃薯与油菜科学观测实验站 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31760409,31460368);云南省农业联合重点项目[2017FG001(-012)];国际马铃薯中心合作项目TON(14.1432.5-001.00)资助。 |
| |
| 摘 要： | 广谱抗性基因的挖掘是马铃薯高抗晚疫病品种选育的基础。本研究以288份国际马铃薯中心筛选的晚疫病抗性群体为试验材料,经过连续2年田间调查,计算AUDPC和sAUDPC值,评估群体晚疫病抗性;利用SLAF-seq方法进行群体简化基因组测序,通过对晚疫病抗性表型数据的全基因组关联分析,挖掘晚疫病抗性相关的遗传位点和候选基因,为晚疫病抗性品种选育和抗病机理研究提供一定的理论和材料基础。结果表明,晚疫病抗性在288份材料间存在着广泛的遗传差异;基于5种分析模型,共鉴定到82个与晚疫病抗性显著关联的位点;在关联区间关联到54个已知或可能与晚疫病抗性相关的基因。其中,23个基因为抗性基因,包括晚疫病抗性基因R1同源基因、Sw-5同源基因(R8)和Rpi-vnt1以及编码多效性耐药蛋白基因;5个基因编码MAPK蛋白和WRKY转录因子;1个基因参与茉莉酸途径;3个基因与水杨酸途径相关;6个基因是病程相关的基因;3个基因参与苯基丙酸类合成途径;其他与晚疫病抗性相关的基因,如HMGR基因(2个)、细胞色素P450(21个)。
|
| 关 键 词： | 马铃薯 晚疫病抗性 全基因组关联分析 抗性基因 国际马铃薯中心 |
Genome-wide association analysis for late blight resistance of potato resources |
| |
| JIANG Wei,PAN Zhe-Chao,BAO Li-Xian,ZHOU Fu-Xian,LI Yan-Shan,SUI Qi-Jun,LI Xian-Ping. Genome-wide association analysis for late blight resistance of potato resources[J]. Acta Agronomica Sinica, 2021, 0(2): 245-261 |
| |
| Authors: | JIANG Wei PAN Zhe-Chao BAO Li-Xian ZHOU Fu-Xian LI Yan-Shan SUI Qi-Jun LI Xian-Ping |
| |
| Affiliation: | (Industrial Crops Research Institute,Yunnan Academy of Agricultural Science,Kunming 650205,Yunnan,China;Scientific Observing and Experimental Station of Potato and Rapeseed in Yunnan-Guizhou Plateau,Kunming 650200,Yunnan,China) |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | potato late blight resistance genome-wide association analysis resistance gene CIP |
| 本文献已被 CNKI 维普 等数据库收录！ |
|
