| 青稞HbTsi1的克隆及其序列特征与表达特性分析 |
| |
| 引用本文： | 曾兴权,王玉林,原红军,徐齐君,尼玛扎西.青稞HbTsi1的克隆及其序列特征与表达特性分析[J].西北农业学报,2015,24(9):56-52. |
| |
| 作者姓名： | 曾兴权 王玉林 原红军 徐齐君 尼玛扎西 |
| |
| 作者单位： | （1.西藏自治区农牧科学院，拉萨 850002；2.西藏自治区青稞种质改良和牦牛繁育重点实验室，拉萨 850002） |
| |
| 基金项目： | 973计划前期研究专项（2012CB723006）；国家科技支撑计划（2012BAD03B01，2013BAD30B01）；西藏财政专项（2014CZZ001）。 |
| |
| 摘 要： | 为了探究DREB类基因在青稞干旱胁迫下的表达模式,通过RT-PCR技术从抗旱品种‘喜马拉雅10号’中克隆其中的一个基因全长cDNA,并利用Real Time PCR方法研究其在干旱胁迫、复水条件下的表达情况。结果表明:从抗旱材料中克隆一个1 237bp全长cDNA序列,命名为HbTsi1(登录号:KJ699390)。生物信息学分析表明,该序列开放阅读框长为837bp,编码278个氨基酸序列,由HbTsi1的ORF推测所编码的蛋白,预测分子质量为30.33ku,等电点(pI)为6.11。Prosite Scan分析结果表明,该基因含有AP2/ERF domain profile家族特征基序、1个Bipartite nuclear localization signal profile、6个蛋白激酶C磷酸化位点、6个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、5个N-豆蔻酰化位点、2个cAMP和cGMP依赖性的蛋白激酶磷酸化位点、2个氮糖基化位点。TMHMM预测该蛋白不含跨膜转移功能区。Signal IP3.0预测该蛋白没有信号肽,不属于分泌蛋白。PSORT亚细胞定位预测该基因所编码蛋白位于细胞质。推导的氨基酸序列同源比对分析结果表明,HbTsi1蛋白与短芒大麦的DREB蛋白具有较高的相似性。利用实时定量PCR方法研究HbTsi1在干旱胁迫条件下及复水后不同时间点的表达情况,发现HbTsi1在土壤绝对含水量为33.4%时表达量最高,随着土壤绝对含水量的下降而下调表达;当达到作物正常生长所需的土壤绝对含水量时又开始上调表达;进行干旱胁迫后(15.5%)基因表达量下降;复水后8h时恢复至最高表达水平。说明,HbTsi1基因可能是青稞抗旱节水的关键基因。
|
| 关 键 词： | 青稞 干旱胁迫 HbTsi1 基因克隆 表达模式 |
Cloning and Characterization of HbTsi1 in Tibetan Hulless Barley |
| |
| ZENG Xingquan,WANGYulin,YUAN Hongjun,XU Qijun and Nimazhaxi.Cloning and Characterization of HbTsi1 in Tibetan Hulless Barley[J].Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica,2015,24(9):56-52. |
| |
| Authors: | ZENG Xingquan WANGYulin YUAN Hongjun XU Qijun and Nimazhaxi |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | Tibet barley Drought stress HbTsi1 Gene cloning Expression pattern |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《西北农业学报》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《西北农业学报》下载免费的PDF全文 |
|
