杜仲MVA途径相关基因全长cDNA序列特征研究 |
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引用本文: | 王淋,乌云塔娜,刘慧敏,叶生晶,杜红岩.杜仲MVA途径相关基因全长cDNA序列特征研究[J].中南林业科技大学学报,2014(1):94-102. |
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作者姓名: | 王淋 乌云塔娜 刘慧敏 叶生晶 杜红岩 |
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作者单位: | 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室;中南林业科技大学林学院;中国林业科学研究院经济林研发中心; |
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基金项目: | 国家林业公益性行业科研专项(201004029);国家“十二五”科技支撑计划项目(2012BAD21B0502) |
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摘 要: | 杜仲幼果和成熟果转录组测序的基础上,分离鉴定了幼果和成熟果MVA途径ACOT、HMGS、HMGR基因全长cDNA序列,并对基因的核苷酸序列及其相应氨基酸序列的组成成分、跨膜结构域、疏水性/亲水性、蛋白质二、三级结构、分子系统进化等进行分析。EuACOT基因全长cDNA为1 248 bp,编码416个氨基酸,属于稳定疏水性蛋白,无明显的跨膜区,在进化上分属于不同的分类群,与烟草和番茄的ACOT蛋白间的亲缘关系最为接近;EuHMGS基因全长cDNA为1 356 bp,编码452个氨基酸,属于不稳定的疏水性蛋白,无明显的跨膜区,在进化上分属于不同的分类群,与茶树的HMGS蛋白间的亲缘关系最为接近;EuHMGR基因全长cDNA为1 770 bp,编码590个氨基酸,属于不稳定的疏水性蛋白,有两个较明显的跨膜区,在进化上分属于不同的分类群,与杜仲的HMGR蛋白间的亲缘关系最为接近;以上三个蛋白的二级结构均是以α-螺旋和螺环结构为主的混合型结构。
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关 键 词: | 杜仲 萜类物质 MVA途径 序列分析 生物信息学 |
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