| miR-15b靶基因预测、信号通路分析及靶基因鉴定 |
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| 作者姓名： | 孙文阳 蓝静 陈磊 闫尊强 王金勇 滚双宝 |
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| 作者单位： | 1. 甘肃农业大学动物科学技术学院,甘肃 兰州 730070;重庆市畜牧科学院,重庆 荣昌 402460;2. 重庆市畜牧科学院,重庆 荣昌,402460;3. 甘肃农业大学动物科学技术学院,甘肃 兰州 730070;甘肃省现代养猪工程技术研究中心,甘肃 兰州 730070 |
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| 基金项目： | 重庆市基本科研业务费项目,国家自然基金项目,甘肃省科技重大专项项目"高繁殖力猪新品系选育研究" |
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| 摘 要： | 【目的】对miR-15b靶基因进行预测、信号通路分析及鉴定,以期为miR-15b的功能研究奠定基础.【方法】利用Target Scan Release 7.0,PicTar和PITA数据库对miR-15b靶基因进行预测,再用DAVID数据库对预测出的靶基因集进行功能富集分析(gene ontology-analysis)及信号转导通路富集分析(KEGG pathway analysis).随后利用双荧光素酶报告试验对预测出miR-15b的靶基因丙酮酸脱氢酶激酶4(PDK4)和CD28进行验证.【结果】3个软件共同预测出miR-15b的靶基因有305个,其靶基因集合功能富集于蛋白激酶活性、GTP结合蛋白调控等分子功能,蛋白氨基酸磷酸化、细胞周期调控等生物学过程及微管相关复合体、转录因子复合体等细胞组分上.信号转导通路则显著富集于癌症相关信号通路.双荧光素酶报告实验结果显示CD28为miR-15b的靶基因,而PDK4不是miR-15b的靶基因.【结论】miR-15b在细胞增殖、凋亡和细胞周期调控等过程中发挥重要调控作用,且miR-15b通过调控CD28的表达对T细胞的受体激活发挥调控作用.
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| 关 键 词： | miR-15b 生物信息学 靶基因验证 |
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