| 拟南芥高亲和性K+载体蛋白基因cDNA克隆及其序列特征分析 |
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| 引用本文： | 王丽,张俊莲,张金文,刘玉汇,白江平,余斌,杨宏羽,王蒂.拟南芥高亲和性K+载体蛋白基因cDNA克隆及其序列特征分析[J].草业学报,2013,22(6):230-238. |
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| 作者姓名： | 王丽 张俊莲 张金文 刘玉汇 白江平 余斌 杨宏羽 王蒂 |
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| 作者单位： | 1.甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室,甘肃 兰州730070;2.甘肃农业大学生命科学技术学院,甘肃 兰州730070;3.甘肃省干旱生境作物学重点实验室,甘肃 兰州 730070;4.甘肃农业大学农学院,甘肃 兰州730070 |
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| 基金项目： | 高等学校博士学科点专项科研基金;国家科技支撑计划;甘肃省干旱生境作物学重点实验室开放基金 |
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| 摘 要： | 以NaCl胁迫处理的拟南芥幼苗叶片为材料,用RNA提取试剂盒抽提总RNA,通过RT-PCR技术和DNA序列测定分析,证实获得了拟南芥高亲和性K+载体蛋白基因(AtHKT1)的cDNA序列。该cDNA全长1521 bp,包括506个氨基酸和1个终止密码子序列,且与原序列(accession number AF237672)同源性为99.34%,但与其他科植物HKT1基因同源性较低,注册该基因到GenBank中,注册号为AY685182。利用生物信息学相关软件分析预测AtHKT1基因蛋白质功能和结构,结果发现,该蛋白分子量为57.45 kD,理论等电点为9.33;氨基酸序列中第1～40个氨基酸属信号肽序列;第152～500个氨基酸属Trk H阳离子转运体蛋白保守结构域,并存在蛋白激酶C,酪氨酸蛋白激酶,依赖cAMP/cGMP蛋白激酶磷酸化,糖基化和豆蔻酰化等功能位点;该基因编码的蛋白有10个跨膜结构,N末端、C末端及中部等多个跨膜区具疏水性,符合载体类运输蛋白特点。表明本研究获得了拟南芥AtHKT1基因。
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| 关 键 词： | 拟南芥 高亲和性K+载体蛋白 RT-PCR技术 生物信息学分析 |
Cloning and analysis of sequence characteristics of cDNA encoding the AtHKT1 gene from Arabidopsis thaliana leaves |
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| WANG Li,ZHANG Jun-lian,ZHANG Jin-wen,LIU Yu-hui,Bai Jiang-ping,YU Bin,YANG Hong-yu,WANG Di.Cloning and analysis of sequence characteristics of cDNA encoding the AtHKT1 gene from Arabidopsis thaliana leaves[J].Acta Prataculturae Sinica,2013,22(6):230-238. |
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| Authors: | WANG Li ZHANG Jun-lian ZHANG Jin-wen LIU Yu-hui Bai Jiang-ping YU Bin YANG Hong-yu WANG Di |
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| Institution: | 1.Gansu Key Laboratory of Crop Genetic & Germplasm Enhancement, Lanzhou 730070, China; 2.College of Life Sciences and Technology,Gansu Agricultural University, Lanzhou 730070, China; 3.Gansu Provincial Key Lab of Aridland Crop Science, Lanzhou 730070, China; 4.College of Agronomic, Gansu Agricultural University, Lanzhou 730070, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | |
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