湖州河川沙塘鳢群体线粒体DNA cyt b基因序列的遗传多样性分析 |
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引用本文: | 卞玉玲,刘士力,刘一诺,贾永义,李飞,迟美丽,郑建波,程顺,顾志敏.湖州河川沙塘鳢群体线粒体DNA cyt b基因序列的遗传多样性分析[J].水产学杂志,2023(1):22-28+35. |
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作者姓名: | 卞玉玲 刘士力 刘一诺 贾永义 李飞 迟美丽 郑建波 程顺 顾志敏 |
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作者单位: | 1. 上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室;2. 浙江省淡水水产研究所农业农村部淡水渔业健康养殖重点实验室/浙江省淡水水产遗传育种重点实验室;3. 上海海洋大学上海水产养殖工程技术研究中心;4. 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心 |
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基金项目: | 浙江省农业新品种选育重大科技专项(2021C02069-3);;国家重点研发计划蓝色粮仓科技创新项目(2018YFD0901305);;浙江省省属科研院所扶持专项(2017F30037); |
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摘 要: | 河川沙塘鳢具有肉鲜味美,细嫩可口的特点,营养价值与经济价值颇高,是一种极具发展潜力的水产养殖品种,对野生和人工繁育河川沙塘鳢的遗传结构进行检测分析,可为选育和种质保护提供参考资料。本文对湖州河川沙塘鳢(钟管野生群体及八里店养殖群体)的线粒体细胞色素b(cyt b)基因全长进行扩增和测序,并应用生物信息学软件与Gen Bank中太湖、鄱阳湖和巢湖3个群体的数据进行比较。河川沙塘鳢cyt b基因全长1141 bp,4种碱基在所得序列中平均含量为A(26.8%)、G(13.8%)、T(28.0%)、C(31.4%),序列分析显示,cyt b基因序列中变异位点378个,占分析位点的44.26%,含有241个简约信息位点,平均转颠换比值(TS/TV)为0.76。在5个群体138个个体中共检测到75个单倍型,平均单倍型多样性为0.869~1.000,核苷酸多样性为0.01431~0.03848。各群体间遗传距离差异较大(0.01493~0.05868),其中八里店与钟管群体的遗传距离最小(0.01493),而鄱阳湖与巢湖群体的遗传距离最大(0.05868),与构建的聚类图分析结果一致。群体中性检验...
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关 键 词: | 河川沙塘鳢 线粒体DNA 细胞色素b基因 遗传分化 |
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