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| 弓形虫致密颗粒蛋白GRA12的生物信息学分析 | |
| 作者单位： | ;1.吉林农业大学生命科学学院;2.吉林省畜牧兽医科学研究院;3.吉林大学畜牧兽医学院 |
| 摘 要： | 为分析并预测弓形虫致密颗粒蛋白GRA12基因编码蛋白的结构、功能以及其作为疫苗候选抗原的可能性,本研究从Gen Bank数据库获取GRA12基因序列,通过在线蛋白分析专家系统(Expasy)并结合GENERUNR、DNAStar、DNAMAN等生物信息学分析软件对GRA12序列的编码区进行分析、对该基因编码蛋白质的理化性质、信号肽、跨膜结构域、二级结构、亲/疏水性、抗原表位等信息预测。结果表明:该基因全长1 311 bp,编码436个氨基酸,蛋白性质稳定,理论分子质量约为47.8 ku,无信号肽,有6个跨膜区,14个丝氨酸磷酸化位点、7个苏氨酸磷酸化位点、3个酪氨酸磷酸化位点、18个O-糖基化位点、3个乙酰化蛋白附着位点、1个酪氨酸硫酸化位点、1个潜在的N-糖基化位点、1个棕榈酰化位点,15个潜在的抗原表位。研究结果分析说明GRA12有潜力成为弓形虫疫苗候选抗原。 |
| 关 键 词： | 弓形虫 GRA12 生物信息学 蛋白质结构 抗原表位 |
Bioinformatics analysis of dense granule protein GRA12 of Toxoplasma gondii |
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