| 番茄斑萎病毒属病毒S RNA序列比对 |
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| 作者姓名： | 徐小刚 刘雅婷 |
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| 作者单位： | 云南农业大学,农学与生物技术学院,云南,昆明,650201;云南农业大学,烟草学院,云南,昆明,650201 |
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| 基金项目： | 国家"973"计划项目,云南省自然科学基金项目,云南省教育厅项目 |
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| 摘 要： | 从生物信息数据库NCBI中搜索并下载最新有关番茄萎斑病毒属Tospovirus各种间S RNA片段全长序列以及该片段上NSs、N的核酸和蛋白质序列着手,运用DNAstar和DNAMAN以及NPSA等生物信息软件对其进行比对分析,结果发现,以NSs蛋白序列建立的系统进化树显示CCSV和TZSV之间的同源性为85.8%,IYSV和TYRV之间的同源性达90%,MYSV和PSMV间的同源性为97.5%;通过N蛋白序列分析显示,Tospovirus属中有7组同源性较高的种;在Tospovirus属病毒中非极性氨基酸含量最高,极性酸性氨基酸最少,比较TSWV中抗性破坏RB株系与普通株系在NSs、N核酸、蛋白质序列、氨基酸含量和蛋白质二级结构之间的差异,发现差异不显著.
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| 关 键 词： | 番茄斑萎病毒属 核壳体序列 SRNA上的非结构蛋白序列 抗性破坏 |
| 收稿时间： | 2009-09-02 |
| 修稿时间： | 2010-01-06 |
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