| 表达在猪卵巢组织的新直向同源基因SLC25A3的模拟分析及其试验研究 |
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| 引用本文： | 潘增祥,张金璧,林飞,李齐发,谢庄,刘红林.表达在猪卵巢组织的新直向同源基因SLC25A3的模拟分析及其试验研究[J].中国农业科学,2010,43(9):1926-1932. |
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| 作者姓名： | 潘增祥 张金璧 林飞 李齐发 谢庄 刘红林 |
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| 作者单位： | （南京农业大学动物科技学院） |
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| 基金项目： | 国家重大科学研究计划项目，南京农业大学青年基金 |
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| 摘 要： | 目的借助比较基因组学、模拟分析和具体试验,快速获取直向同源序列结构和功能信息。方法通过"基于模式生物基因导向的EST功能注释法"鉴别出猪直向同源ESTs,以一个直向同源的线粒体磷酸载体编码基因SLC25A3为基础,结合组织表达信息,筛选卵巢组织中表达的ESTs序列进行该基因的虚拟克隆,并通过引物步移法进行具体的试验序列研究。结果鉴别、获取了直向同源基因SLC25A3的基因结构及功能信息,进行了试验具体研究,获得了该基因的cDNA全序列,实现了功能信息的物种间传递。结论结合基于模式生物基因导向的EST功能注释法和大量生物信息学工具,可以快速获得直向同源基因及其序列和功能信息,实现有价值信息在物种间的快捷转移和传递,为比较基因组学研究中序列功能注释与分析提供可靠的选择。
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| 关 键 词： | 猪 直向同源 比较基因组学 模拟研究 生物信息学 |
| 收稿时间： | 2009-09-11; |
In Silico Study on a New Orthologs SLC25A3 and It's Experimental Verification in Porcine Ovary |
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| PAN Zeng-xiang,ZHANG Jin-bi,LIN Fei,LI Qi-fa,XIE Zhuang,LIU Hong-lin.In Silico Study on a New Orthologs SLC25A3 and It's Experimental Verification in Porcine Ovary[J].Scientia Agricultura Sinica,2010,43(9):1926-1932. |
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| Authors: | PAN Zeng-xiang ZHANG Jin-bi LIN Fei LI Qi-fa XIE Zhuang LIU Hong-lin |
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| Institution: | PAN Zeng-xiang,ZHANG Jin-bi,LIN Fei,LI Qi-fa,XIE Zhuang,LIU Hong-lin (College of Animal Science , Technology,Nanjing Agricultural University,Nanjing 210095) |
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| Abstract: | Objective The objective of this study is to efficiently obtain the structural and functional information of orthologs. Method The approach of gene-oriented ESTs annotation based on model organisms, in silico analysis and the method of primers extension were combined in the study.Result An orthologs SLC25A3 (Solute Carrier Family 25, Member 3)by the approach of gene-oriented ESTs annotation based on human cDNA sequences was identified, and then the homologous ESTs expressed in porcine ovary were selected for... |
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| Keywords: | pig orthologs comparative genomics in silico study bioinformaitics |
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