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黄瓜、西瓜、南瓜EIN3基因片段的克隆与序列分析
引用本文:陈惠明,卢向阳,许亮,许勇,张海英,刘晓虹.黄瓜、西瓜、南瓜EIN3基因片段的克隆与序列分析[J].农业生物技术学报,2007,15(4).
作者姓名:陈惠明  卢向阳  许亮  许勇  张海英  刘晓虹
作者单位:湖南省蔬菜研究所 湖南农业大学生化与发酵工程实验室 国家蔬菜工程技术研究中心 湖南省蔬菜研究所,湖南省蔬菜工程中心
摘    要:EIN3(Ethylene insensitive 3)是位于细胞核的核蛋白为乙烯信号转导的下游调控基因,根据GenBank所报道的植物EIN3基因mRNA的保守序列设计两个引物,以黄瓜、西瓜、南瓜总DNA为模板PCR扩增到3个725bp的基因片段,将片段序列在NCBI数据库中Blastn同源搜寻,显示151条有同源性的序列全部是EIN3基因,因此推断克隆的3个片段均为EIN3基因家族成员。NCBI网站的ORF Finder找到正确的开放式阅读框,翻译成为氨基酸序列,对CsEIN3、ClEIN3及CmEIN3氨基酸序列在NCBI网站进行Blastp比对, 在大分子结构数据库MMDB (Molecular Modelling Database) 搜索,3个推测蛋白保守结构域三级结构与拟南芥EIN3的DNA结合域(MMDB: 30598 PDB: 1WIJ )完全相同,系统进化分析表明,黄瓜、西瓜、南瓜与双子叶植物甜瓜、绿豆、蒺藜状苜蓿、烟草、番茄、拟南芥及单子叶水稻、桃红蝴蝶兰等的EIN3家族成员都有较高的相似性。

关 键 词:EIN3  基因克隆  黄瓜  西瓜  南瓜
收稿时间:2006-9-15
修稿时间:2006-11-22

Cloning and Sequencing of EIN3 gene from Cucumis sativus, Citrullus lanatus and Cucurbita maxima
Abstract:
Keywords:
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