黄瓜、西瓜、南瓜EIN3基因片段的克隆与序列分析 |
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引用本文: | 陈惠明,卢向阳,许亮,许勇,张海英,刘晓虹.黄瓜、西瓜、南瓜EIN3基因片段的克隆与序列分析[J].农业生物技术学报,2007,15(4). |
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作者姓名: | 陈惠明 卢向阳 许亮 许勇 张海英 刘晓虹 |
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作者单位: | 湖南省蔬菜研究所 湖南农业大学生化与发酵工程实验室 国家蔬菜工程技术研究中心 湖南省蔬菜研究所,湖南省蔬菜工程中心 |
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摘 要: | EIN3(Ethylene insensitive 3)是位于细胞核的核蛋白为乙烯信号转导的下游调控基因,根据GenBank所报道的植物EIN3基因mRNA的保守序列设计两个引物,以黄瓜、西瓜、南瓜总DNA为模板PCR扩增到3个725bp的基因片段,将片段序列在NCBI数据库中Blastn同源搜寻,显示151条有同源性的序列全部是EIN3基因,因此推断克隆的3个片段均为EIN3基因家族成员。NCBI网站的ORF Finder找到正确的开放式阅读框,翻译成为氨基酸序列,对CsEIN3、ClEIN3及CmEIN3氨基酸序列在NCBI网站进行Blastp比对, 在大分子结构数据库MMDB (Molecular Modelling Database) 搜索,3个推测蛋白保守结构域三级结构与拟南芥EIN3的DNA结合域(MMDB: 30598 PDB: 1WIJ )完全相同,系统进化分析表明,黄瓜、西瓜、南瓜与双子叶植物甜瓜、绿豆、蒺藜状苜蓿、烟草、番茄、拟南芥及单子叶水稻、桃红蝴蝶兰等的EIN3家族成员都有较高的相似性。
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关 键 词: | EIN3 基因克隆 黄瓜 西瓜 南瓜 |
收稿时间: | 2006-9-15 |
修稿时间: | 2006-11-22 |
Cloning and Sequencing of EIN3 gene from Cucumis sativus, Citrullus lanatus and Cucurbita maxima |
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