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猪FAM213B基因mRNA和启动子的克隆及序列分析
引用本文:张爱玲,孙显月,卢孝璋,李加琪,张豪.猪FAM213B基因mRNA和启动子的克隆及序列分析[J].华南农业大学学报,2017,38(3):1-8.
作者姓名:张爱玲  孙显月  卢孝璋  李加琪  张豪
作者单位:1. 广东第二师范学院 生物与食品工程学院/广东高校应用生态工程技术开发中心,广东 广州 510303;华南农业大学 动物科学学院/广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室,广东 广州 510642;2. 华南农业大学 动物科学学院/广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室,广东 广州,510642
基金项目:国家自然科学基金(31201771);现代农业产业技术体系专项(CARS-36)
摘    要:【目的】获得猪FAM213B基因完整mRNA和启动子序列,研究猪FAM213B基因表达,为探讨母猪妊娠的建立和胚胎发育调控机制奠定基础。【方法】通过5'RACE和3'RACE技术,获得基因完整mRNA序列,分析不同物种该基因氨基酸序列相似性;通过PCR克隆启动子区,并通过双荧光素酶报告基因载体系统转染猪子宫内膜细胞,研究其转录活性。【结果】猪FAM213B基因mRNA全长808 bp,其中5'UTR、CDS区和3'UTR长度分别为67、609(含终止密码子)和132 bp(不含poly A序列),在17~106位氨基酸之间存在硫氧还蛋白折叠结构域;与猪FAM213B基因其他2个潜在转录本相比,三者都包含硫氧还蛋白折叠结构域,但蛋白三级结构存在较大差异;猪FAM213B氨基酸序列与山羊、牛和绵羊高度相似,相似性分别为94.03%、93.03%和91.54%。克隆获得2 261 bp(-2 231/+30)的基因启动子序列,将其连接至双荧光素酶报告基因载体,转染猪子宫内膜细胞,发现获得的启动子片段能够启动下游报告基因的转录,在启动子区存在潜在的典型NFκB等转录因子结合位点。【结论】本研究获得猪FAM213B基因转录本长度为808 bp,其蛋白存在硫氧还蛋白折叠功能结构域,其启动子序列(-2 231/+30)在猪子宫内膜细胞中具有较强的转录活性。

关 键 词:  FAM213B基因  转录  启动子  克隆  子宫内膜细胞  硫氧还蛋白
收稿时间:2016/7/24 0:00:00

Cloning and sequence analysis of mRNA and promoter of pig FAM213B gene
ZHANG Ailing,SUN Xianyue,LU Xiaozhang,LI Jiaqi and ZHANG Hao.Cloning and sequence analysis of mRNA and promoter of pig FAM213B gene[J].Journal of South China Agricultural University,2017,38(3):1-8.
Authors:ZHANG Ailing  SUN Xianyue  LU Xiaozhang  LI Jiaqi and ZHANG Hao
Institution:1 Biology and Food Engineering Institute, Guangdong University of Education/Guangdong Development Center of Applied Ecology and Ecological Engineering in Universities,2 College of Animal Science, South China Agricultural University/Guangdong Provincial Key Laboratory of Agro-animal Genomics and Molecular Breeding,,2 College of Animal Science, South China Agricultural University/Guangdong Provincial Key Laboratory of Agro-animal Genomics and Molecular Breeding,,2 College of Animal Science, South China Agricultural University/Guangdong Provincial Key Laboratory of Agro-animal Genomics and Molecular Breeding,,2 College of Animal Science, South China Agricultural University/Guangdong Provincial Key Laboratory of Agro-animal Genomics and Molecular Breeding, and 2 College of Animal Science, South China Agricultural University/Guangdong Provincial Key Laboratory of Agro-animal Genomics and Molecular Breeding,
Abstract:
Keywords:
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