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正交优化芒果SRAP扩增体系及引物筛选
引用本文:应东山,罗海燕,王明,李莉萍,王琴飞,朱敏,陈业渊.正交优化芒果SRAP扩增体系及引物筛选[J].热带作物学报,2014,35(4):700-705.
作者姓名:应东山  罗海燕  王明  李莉萍  王琴飞  朱敏  陈业渊
作者单位:中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业部华南作物基因资源与种质创制重点开放实验室;中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业部华南作物基因资源与种质创制重点开放实验室;中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业部华南作物基因资源与种质创制重点开放实验室;中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业部华南作物基因资源与种质创制重点开放实验室;中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业部华南作物基因资源与种质创制重点开放实验室;中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业部华南作物基因资源与种质创制重点开放实验室;中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业部华南作物基因资源与种质创制重点开放实验室
基金项目:农业部公益性行业(农业)科研专项“芒果产业技术研究与示范”项目(No. 201203092);中国热带农业科学研究院热带作物品种研究所导师基金(No. DSJJ2010-04;No. 3100879);中国热带农业科学院非营利性科研机构改革启动经费项目(No. pzs-201306)。
摘    要:利用正交实验设计,对芒果SRAP-PCR反应的5因素(Mg2+、dNTPs、模板DNA、引物和Taq DNA聚合酶)4水平的扩增效果进行研究,确立适合芒果SRAP-PCR反应的最佳体系。总体积25μL的SRAP-PCR优化的最佳反应体系中含有:2.5μL 10×buffer、20 ng模板DNA、2.5 mmol/L Mg2+、0.2 mmol/L dNTPs、0.4μmo1/L Primer、Taq DNA聚合酶1.5 U。并运用该体系从153对引物组合中初步筛选出50对SRAP引物组合。建立的SRAP标记可为芒果遗传多样性、分子标记及辅助育种等提供研究基础。

关 键 词:芒果  SRAP  正交设计  体系优化

Optimized Conditions of Sequence-related Amplified Polymorphism(SRAP) System and Primer Screening for Mango
YING Dongshan,LUO Haiyan,WANG Ming,LI Liping,WANG Qinfei,ZHU Min and CHEN Yeyuan.Optimized Conditions of Sequence-related Amplified Polymorphism(SRAP) System and Primer Screening for Mango[J].Chinese Journal of Tropical Crops,2014,35(4):700-705.
Authors:YING Dongshan  LUO Haiyan  WANG Ming  LI Liping  WANG Qinfei  ZHU Min and CHEN Yeyuan
Abstract:
Keywords:
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