| 甘蓝型油菜AVP1、VHA-a2和VHA-a3基因的鉴定及功能性研究 |
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| 引用本文： | 姚珺玥,华营鹏,周婷,王涛,宋海星,官春云,张振华.甘蓝型油菜AVP1、VHA-a2和VHA-a3基因的鉴定及功能性研究[J].作物学报,2019,45(8):1146-1157. |
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| 作者姓名： | 姚珺玥 华营鹏 周婷 王涛 宋海星 官春云 张振华 |
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| 作者单位： | 湖南农业大学资源环境学院;南方粮油作物协同创新中心;国家油料作物改良中心湖南分中心 |
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| 基金项目： | This study was supported by the National Key R&D Program of China(2018YFD0200901);This study was supported by the National Key R&D Program of China(2018YFD0200906);the China Agriculture Research System(CARS-13) |
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| 摘 要： | 液泡是调控植物细胞分化、生长发育的重要部位,AVP1、VHA-a2和VHA-a3基因调控植物液泡内外离子平衡、离子运输以及能量供应。本研究利用功能已知的拟南芥AVP1、VHA-a2和VHA-a3基因为参考序列在甘蓝型油菜全基因组数据库、NCBI植物基因组注释数据库等鉴定并筛选出9个BnaAVP1、3个BnaVHA-a2和4个BnaVHA-a3,并分析基因拷贝数变异、分子特征、跨膜结构域、保守基序、染色体定位、系统进化树构建、蛋白二级结构及三维结构预测、高通量转录组测序等。发现甘蓝型油菜BnaAVP1和BnaVHA-a3的基因数量明显多于甘蓝和白菜;甘蓝型油菜AVP1、VHA-a2和VHA-a3蛋白属于由酸性氨基酸组成的稳定蛋白;系统进化选择能力的分析表明,甘蓝型油菜AVP1、VHA-a2和VHA-a3家族基因与甘蓝、白菜关系相近。转录组测序表明,低氮处理后,BnaAVP1s基因主要在地上部表达,且低氮3h后地上部表达下调,低氮处理72h根中表达量上调;BnaVHA-a2s和BnaVHA-a3s基因在地上部和根中均有表达,BnaVHA-a2s在低氮处理72h后表达量基本呈上调趋势,BnaVHA-a3s在低氮3h后基本呈下调趋势。低磷处理后,BnaAVP1s根中大部分基因表达上调,地上部表达基本无差异;BnaVHA-a2s表达基本无差异;BnaVHA-a3s地上部和根中均基本为上调趋势。该结果为进一步研究甘蓝型油菜AVP1、VHA-a2和VHA-a3基因生物学功能及AVP1、VHA-a2和VHA-a3蛋白水解ATP提供能量供植物代谢的分子机制奠定基础,为已知大量数据的其他物种家族基因生物信息学研究提供参考。
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| 关 键 词： | 甘蓝型油菜 AVP基因 VHA基因 生物信息学 |
| 收稿时间： | 2018-09-20 |
Identification and function analysis of AVP1, VHA-a2, and VHA-a3 genes in Brassica napus L. |
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| YAO Jun-Yue,HUA Ying-Peng,ZHOU Ting,WANG Tao,SONG Hai-Xing,GUAN Chun-Yun,ZHANG Zhen-Hua.Identification and function analysis of AVP1, VHA-a2, and VHA-a3 genes in Brassica napus L.[J].Acta Agronomica Sinica,2019,45(8):1146-1157. |
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| Authors: | YAO Jun-Yue HUA Ying-Peng ZHOU Ting WANG Tao SONG Hai-Xing GUAN Chun-Yun ZHANG Zhen-Hua |
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| Institution: | 1.College of Resource and Environment, Hunan Agricultural University, Changsha 410128, Hunan, China;2.Southern Regional Collaborative Innovation Center for Grain and Oil Crops in China, Changsha 410128, Hunan, China;3.Hunan Branch, National Oil Crops Improvement Center, Changsha 410128, Hunan, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Brassica napus L AVP gene VHA gene bioinformatics |
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