斑点叉尾鮰趋化因子SCYA126基因及其可变剪接

通过探针杂交筛选斑点叉尾鮰（Ictalurus punctatus）BAC基因组文库,利用引物步移的方法对阳性克隆BAC047_K12进行序列测定,得到2815bp的SCYA126基因组序列。序列分析表明,SCYA126基因由2个外显子和1个内含子组成;外显子拼接的序列与SCYA126 cDNA序列完全一致,编码92个氨基酸,在N端含有2个相邻的半胱氨酸（CC）和2个不相邻的半胱氨酸,为典型的CC趋化因子亚家族成员;其上游调控序列包含TATA框启动子序列和一些与免疫相关的转录因子结合位点。另外,根据与GenBank接收号为BM029630的EST序列的比较分析,发现SCYA126基因组中的内含子没有被剪接,导致翻译后可能产生N端部分缺失的SCYA126蛋白。在胰脏和肝脏中确认了高表达的包含内含子的mRNA的存在,而且其表达量要明显高于正常剪接的SCYA126mRNA。