猪PPAR α蛋白的生物信息学分析

笔者为了探究PPAR的结构和生物学功能,利用生物基因组学数据库,对猪PPAR的氨基酸序列进行初步的生物信息学分析。结果表明,猪PPAR基因编码468个氨基酸,平均分子质量为52.17k Da,为不稳定的亲水蛋白;该蛋白不存在信号肽和跨膜结构域,包含9个潜在的O-糖基化位点和28个磷酸化位点;二级结构由α螺旋、β转角、延伸链和随机卷曲组成;该蛋白具有Zn-C4和HOLI两个功能结构域;系统进化分析显示,猪与猫、犬的亲缘关系最近。