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刺参微卫星DNA分子标记的分离及筛选
引用本文:丁君,曹洁,李润玲,孙效文,常亚青.刺参微卫星DNA分子标记的分离及筛选[J].大连水产学院学报,2006,21(2):95-99.
作者姓名:丁君  曹洁  李润玲  孙效文  常亚青
作者单位:大连水产学院,农业部海洋水产增养殖学与生物技术重点开放实验室,辽宁,大连,116023
基金项目:国家自然科学基金;辽宁省大连市科技计划
摘    要:采用磁珠富集法分离刺参Apostichopus japonicus的微卫星分子标记,共获得阳性克隆123个,其中106个含微卫星DNA序列。分析结果表明:完美型有48个,占45.28%,非完美型有39个,占36.79%,复合型有19个,占17.92%;重复碱基数以双核苷酸重复最常见,占84.91%,双核苷酸中又以CA/GT重复所占比例最大;在重复次数方面,以重复数为3~10次、11~18次和≥35次最为常见,各占39.62%、26.42%和16.98%,重复数达100次以上的有5个,最多的达到148次,有28个微卫星序列微卫星含量丰富。筛选的22对引物中,可产生出扩增产物的有17对,其中16对引物的产物带在预测区域内出现;有7对引物在中国、俄罗斯刺参模板中表现出多态性。文中还对刺参微卫星的特点进行分析,对刺参微卫星引物的PCR筛选结果进行了探讨。

关 键 词:微卫星DNA  刺参  磁珠富集
文章编号:1000-9957(2006)02-0095-05
收稿时间:01 10 2006 12:00AM
修稿时间:2006-01-10

Isolation of microsatellite markers and screening microsatellite markers from sea cucumber (Apostichopus japonicus)
DING Jun,CAO Jie,LI Run-ling,SUN Xiao-wen,CHANG Ya-qing.Isolation of microsatellite markers and screening microsatellite markers from sea cucumber (Apostichopus japonicus)[J].Journal of Dalian Fisheries University,2006,21(2):95-99.
Authors:DING Jun  CAO Jie  LI Run-ling  SUN Xiao-wen  CHANG Ya-qing
Abstract:
Keywords:Microsatellite DNA  Apostichopus japonicus  enrichment by magnetic beads
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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