| 牦牛ACTA1基因启动子区克隆、DNA甲基化与组织表达相关性分析 |
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| 引用本文： | 杨勤,柴志欣,王吉坤,王会,钟金城.牦牛ACTA1基因启动子区克隆、DNA甲基化与组织表达相关性分析[J].华北农学报,2020,35(1):222-229. |
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| 作者姓名： | 杨勤 柴志欣 王吉坤 王会 钟金城 |
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| 作者单位： | 西南民族大学 青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省、教育部重点实验室,四川 成都 610041,西南民族大学 青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省、教育部重点实验室,四川 成都 610041,西南民族大学 青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省、教育部重点实验室,四川 成都 610041,西南民族大学 青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省、教育部重点实验室,四川 成都 610041,西南民族大学 青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省、教育部重点实验室,四川 成都 610041 |
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| 基金项目： | 国家肉牛牦牛产业技术体系;西南民族大学研究生创新型科研项目;四川省科技厅应用基础项目 |
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| 摘 要： | 为了探究骨骼肌α肌动蛋白1(ACTA1)基因在肌肉和脂肪等6个组织中的甲基化状态及mRNA表达水平,以类乌齐牦牛、麦洼牦牛为研究对象,成功克隆了牦牛ACTA1基因启动子区序列,且采用重亚硫酸氢盐测序法(BSP)检测ACTA1基因启动子区甲基化模式,并通过实时荧光定量PCR检测ACTA1基因在臀大肌、心脏、肾脏、肺脏、肝脏和脂肪组织中的mRNA表达水平。结果显示,牦牛ACTA1基因转录起始位点上游及第一外显子区部分序列总长为1 028 bp;BSP法分析发现肌肉组织DNA甲基化水平最低,脂肪组织甲基化率最高,其中,类乌齐牦牛臀大肌、心脏、肾脏、肺脏、肝脏和脂肪的甲基化概率分别为6.25%,6.88%,20.00%,16.25%,26.25%,29.38%,麦洼牦牛臀大肌、心脏、肾脏、肺脏、肝脏和脂肪的甲基化概率分别为5.00%,7.50%,18.13%,20.00%,26.25%,28.75%;ACTA1基因mRNA表达量在肾脏、肺脏、肝脏和脂肪均极显著低于臀大肌(P0.01),且显著低于心脏(P0.05),类乌齐牦牛和麦洼牦牛心脏mRNA表达量具有显著性差异(P0.05),类乌齐牦牛肺脏组织甲基化率显著低于麦洼牦牛(P0.05),其他各组织甲基化率和mRNA表达量差异均不显著(P0.05),各组织甲基化水平与ACTA1基因mRNA表达量呈极显著负相关(r=-0.797,P=0.002)。结果表明,ACTA1基因DNA甲基化模式对肌肉发育具有一定的调控作用,可为牦牛遗传育种表观遗传标记提供部分数据支持。
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| 关 键 词： | 牦牛 ACTA1基因 启动子区 DNA甲基化 重亚硫酸氢盐测序 组织表达 |
Cloning of ACTA1 Gene Promoter Region and Correlation Analysis Between DNA Methylation and Tissue Expression in Yak |
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| YANG Qin,CHAI Zhixin,WANG Jikun,WANG Hui,ZHONG Jincheng.Cloning of ACTA1 Gene Promoter Region and Correlation Analysis Between DNA Methylation and Tissue Expression in Yak[J].Acta Agriculturae Boreali-Sinica,2020,35(1):222-229. |
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| Authors: | YANG Qin CHAI Zhixin WANG Jikun WANG Hui ZHONG Jincheng |
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