不同样品副溶血性弧菌多样性分析 |
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作者姓名: | 马月姣 孙晓红 赵勇 卢瑛 吴启华 潘迎捷 |
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作者单位: | 1. 上海海洋大学食品学院/上海水产品加工及贮藏工程技术研究中心,上海,201306 2. 美国缅因大学食品科学与人类营养系,美国缅因04469 |
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基金项目: | 霍英东教育基金会第十一届高等院校优选资助课题,上海市科学技术委员会部分地方院校能力建设项目,上海市教育委员会重点学科建设项目 |
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摘 要: | ![]() 采用肠细菌基因外重复回文序列扩增(REP-PCR)和肠道细菌基因间重复序列扩增(ERIC-PCR)2种方法,对从3种不同样品中分离得到的副溶血性弧菌进行分型分析;通过REP和ERIC-PCR指纹图谱扩增,利用NT-SYS-pc软件,并采用Dice系数对指纹图谱进行聚类分析.结果显示:55株副溶血性弧菌REP-PCR指纹图聚谱共分为3大类,其中底泥中的优势谱型为Ⅰ类型,海水中的优势谱型为Ⅱ类型,虾样品中的优势谱型为Ⅰ类型;ERIC-PCR指纹谱型也聚类为3大类,在海水和底泥中的优势谱型均为Ⅰ类型,但底泥中副溶血性弧菌多样性较海水中丰富,虾样品中副溶血性弧菌优势谱型为Ⅱ类型.表明不同样品中副溶血性弧菌优势型不同,进而推测不同类型谱型的菌株耐冷特性不同.
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关 键 词: | 副溶血性弧菌 REP-PCR ERIC-PCR 优势谱型 |
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