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微滴式数字PCR定量检测鸡毒支原体方法的建立
引用本文:谢志勤,谢芝勋,张艳芳,范晴,谢丽基,万丽军,罗思思,李孟,张民秀,曾婷婷,黄娇玲,王盛,李丹,韦悠,李小凤,任红玉,阮志华.微滴式数字PCR定量检测鸡毒支原体方法的建立[J].中国动物检疫,2022,39(9):121-127.
作者姓名:谢志勤  谢芝勋  张艳芳  范晴  谢丽基  万丽军  罗思思  李孟  张民秀  曾婷婷  黄娇玲  王盛  李丹  韦悠  李小凤  任红玉  阮志华
基金项目:广西重点研发计划项目(桂科AB16380003);中央引导地方专项(桂科ZY19183013);广西创新驱动专项(AA17204057);国家“万人计划”领军人才专项(W02060083);“广西八桂学者”专项(2019A50)
摘    要:为建立微滴式数字PCR(droplet digital PCR,ddPCR)定量检测鸡毒支原体(Mycoplasma gallisepticum,MG)方法,以MG的mgpc基因序列为目的序列,在其保守区域内设计合成了1对特异性引物和1条探针,通过各反应条件优化,建立了检测MG的ddPCR方法,并测定了建立方法的特异性、敏感性以及重复性。结果显示:建立方法的最佳引物浓度为20 μmol/μL,探针浓度为10 μmol/μL,退火温度为55 ℃;该方法只检出MG,没有检出鸡滑液囊支原体、禽衣阿华支原体、禽流感病毒、鸡新城疫病毒、鸡传染性支气管炎病毒、鸡传染性喉气管炎病毒、禽脑脊髓炎病毒、禽偏肺炎病毒、禽呼肠孤病毒、鸡沙门氏菌和鸡大肠杆菌,且相互间没有交叉反应;本方法最低检测MG重组质粒标准品的检测限为3.9拷贝/μL。重组质粒标准品浓度在3.9~41 025拷贝/μL范围内,绘制的ddPCR绝对定量曲线与测得值呈良好的线性关系(R2 = 0.999);3次重复检测试验结果的变异系数均小于5%。对采集的60份病鸡喉拭子、气囊拭子及肺样品进行MG检测,结果ddPCR方法的阳性检出率(15.0%)高于荧光定量PCR方法(13.3%)。结果表明,本研究建立的ddPCR方法定量检测MG特异性强,灵敏度高,重复性好,为绝对定量检测MG提供了技术手段。

关 键 词:微滴式数字PCR  鸡毒支原体  定量检测

Establishment of a Droplet Digital PCR for Quantitative Detection of Mycoplasma gallisepticum
Xie Zhiqin,Xie Zhixun,Zhang Yanfang,Fan Qing,Xie Liji,Wan Lijun,Luo Sisi,Li Meng,Zhang Minxiu,Zeng Tingting,Huang Jiaoling,Wang Sheng,Li Dan,Wei You,Li Xiaofeng,Ren Hongyu,Ruan Zhihua.Establishment of a Droplet Digital PCR for Quantitative Detection of Mycoplasma gallisepticum[J].China Journal Of Animal Quarantine,2022,39(9):121-127.
Authors:Xie Zhiqin  Xie Zhixun  Zhang Yanfang  Fan Qing  Xie Liji  Wan Lijun  Luo Sisi  Li Meng  Zhang Minxiu  Zeng Tingting  Huang Jiaoling  Wang Sheng  Li Dan  Wei You  Li Xiaofeng  Ren Hongyu  Ruan Zhihua
Abstract:
Keywords:
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