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猪δ冠状病毒实时荧光RT-PCR检测方法的建立与应用
引用本文:苑建军,杨德全,鞠厚斌,庄建萍,葛菲菲,杨显超,李鑫,沈海潇.猪δ冠状病毒实时荧光RT-PCR检测方法的建立与应用[J].中国动物检疫,2022,39(11):115-120.
作者姓名:苑建军  杨德全  鞠厚斌  庄建萍  葛菲菲  杨显超  李鑫  沈海潇
基金项目:上海市自然科学基金项目(04713)
摘    要:为灵敏、快速检测猪δ冠状病毒(porcine deltacoronavirus,PDCoV),根据PDCoV M基因保守区域设计引物和探针,建立了一种PDCoV实时荧光RT-PCR检测方法,并评价了该方法的特异性、灵敏性和重复性。结果显示,该方法的拷贝数对数值与Ct值在1.3×103~1.3×107 copies/μL拷贝数浓度范围内呈现良好的线性关系,R2 = 0.994;最低检出限为13 copies/μL,且无非特异性扩增;批内和批间重复性试验变异系数(CV)为0.24%~2.15%,均小于3%。利用该方法和普通RT-PCR对42份临床样品同时进行检测,发现本方法比普通RT-PCR灵敏性更高,二者符合率为95.2%。以上结果表明,本试验建立的实时荧光RT-PCR方法灵敏、特异、可靠,可用于PDCoV的临床检测和流行病学调查。

关 键 词:猪δ冠状病毒  实时荧光RT-PCR  快速检测  应用

Establishment and Application of a Real-time Fluorescent RT-PCR Assay for Porcine Deltacoronavirus
Yuan Jianjun,Yang Dequan,Ju Houbin,Zhuang Jianping,Ge Feifei,Yang Xianchao,Li Xin,Shen Haixiao.Establishment and Application of a Real-time Fluorescent RT-PCR Assay for Porcine Deltacoronavirus[J].China Journal Of Animal Quarantine,2022,39(11):115-120.
Authors:Yuan Jianjun  Yang Dequan  Ju Houbin  Zhuang Jianping  Ge Feifei  Yang Xianchao  Li Xin  Shen Haixiao
Abstract:
Keywords:
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