| 谷子F-box家族基因的鉴定、分类及干旱响应 |
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| 引用本文： | 霍冬英,郑炜君,李盼松,徐兆师,周永斌,陈明,马有志,闵东红,张小红.谷子F-box家族基因的鉴定、分类及干旱响应[J].作物学报,2014,40(9):1585-1594. |
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| 作者姓名： | 霍冬英 郑炜君 李盼松 徐兆师 周永斌 陈明 马有志 闵东红 张小红 |
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| 作者单位： | 1旱区作物逆境生物学国家重点实验室 / 西北农林科技大学, 陕西杨凌 712100; 2中国农业科学院作物科学研究所 / 农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程 / 农业部麦类生物学与遗传育种重点实验室, 北京 100081 |
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| 基金项目： | 本研究由国家转基因生物新品种培育科技重大专项(2014ZX08002-03B, 2011ZX08002002)资助。 |
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| 摘 要： | F-box蛋白参与细胞周期调控、细胞凋亡及信号转导等多种生命活动,对维持植物正常生长发育a和介导非生物胁迫响应等过程发挥重要作用。谷子具有显著的耐旱耐瘠薄等特性,本研究根据谷子转录组分析结果,从525个F-box家族成员中鉴定出19个在干旱胁迫下表达量上调的F-box基因,根据序列相似性将其分为6类,同一类基因具有相似的内含子-外显子结构。染色体定位分析发现,这些基因分别分布在谷子的8条染色体上,其中,第2条染色体上含F-box基因最多,有6个。结构域分析结果表明,19个F-box蛋白均含保守的F-box结构域,而C端含FBD、WD40、FBA、ZnF、Kelch和LRR等结构域。启动子元件分析表明,谷子19个F-box基因均含逆境应答元件,其中,MYB和MYC元件的数量最多(9~78个),说明这些基因对干旱应答反应可能主要受MYB、MYC转录因子调控。转录组分析结果表明,SiF-box18基因对干旱胁迫的响应远远高于其他F-box成员,对干旱、高盐、ABA、SA和JA都有响应;亚细胞定位结果显示,SiF-box18蛋白定位在细胞核中。本研究为进一步深入了解SiF-box18基因的功能提供了依据。
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| 关 键 词： | 谷子 F-box蛋白 亚细胞定位 干旱响应 诱导机制 |
| 收稿时间： | 2013-12-01 |
Identification,Classification, and Drought Response of F-box Gene Family in Foxtail Millet |
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| HUO Dong-Ying,ZHENG Wei-Jun,LI Pan-Song,XU Zhao-Shi,ZHOU Yong-Bin,CHEN Ming,MA You-Zhi,MIN Dong-Hong,ZHANG Xiao-Hong.Identification,Classification, and Drought Response of F-box Gene Family in Foxtail Millet[J].Acta Agronomica Sinica,2014,40(9):1585-1594. |
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| Authors: | HUO Dong-Ying ZHENG Wei-Jun LI Pan-Song XU Zhao-Shi ZHOU Yong-Bin CHEN Ming MA You-Zhi MIN Dong-Hong ZHANG Xiao-Hong |
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| Institution: | 1.State Key Laboratory of Crop Stress Biology for Arid Areas / Northwest Agricultural and Forestry University, Yangling 712100, China;2.Institute of Crop Science, Chinese Academy of Agricultural Sciences / National Key Facility for Crop Gene Resources and Genetic Improvement / Key Laboratory of Crop Genetics and Breeding, Ministry of Agriculture, Beijing 100081, China? |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Foxtail millet F-box protein Subcellular localization Drought response Induction mechanism |
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