| 葡萄miR164家族生物信息学分析及靶基因预测 |
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| 引用本文： | 王丽丽,葛金涛,刘兴满,赵统利.葡萄miR164家族生物信息学分析及靶基因预测[J].浙江农业学报,2016,28(3):441. |
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| 作者姓名： | 王丽丽 葛金涛 刘兴满 赵统利 |
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| 作者单位： | （连云港市农业科学院，江苏 连云港 222000） |
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| 摘 要： | MicroRNAs（miRNAs）对植物抗逆及生长发育过程起着重要的调控作用，而miR164是植物特有的miRNA，它对应的靶基因主要是NAC转录因子家族。采用生物信息学方法对葡萄以及其他几个物种的miR164家族成员前体进行进化分析、前体二级结构预测、成熟序列碱基保守性分析以及在葡萄NAC转录因子家族71个成员中进行靶基因预测分析。结果表明：葡萄miR164家族成员的前体序列与双子叶植物聚在一个分支，符合进化规律；葡萄miR164家族4个成员前体序列均可形成稳定的二级茎环结构，成熟序列的碱基保守性较高；葡萄miR164家族成员对应的NAC家族靶基因有2个（GSVIVT01007982001与GSVIVT01020478001），经在NCBI进行BLAST分析，发现均与植物的根发育相关。这暗示着葡萄miR164家族与其靶基因在植物的抗逆过程中发挥重要的调控作用。
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| 关 键 词： | 葡萄 miR164 靶基因 抗逆 生物信息学 |
Bioinformatics analysis of the MiR164 family and prediction of target gene in Vitis vinifera |
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| WANG Li li,GE Jin tao,LIU Xing man,ZHAO Tong li.Bioinformatics analysis of the MiR164 family and prediction of target gene in Vitis vinifera[J].Acta Agriculturae Zhejiangensis,2016,28(3):441. |
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| Authors: | WANG Li li GE Jin tao LIU Xing man ZHAO Tong li |
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| Institution: | （Lianyungang Academy of Agricultural Sciences， Lianyungang 222000， China） |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Vitis vinifera miR164 target gene stress resistance bioinformatics |
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