| “全红”体色瓯江彩鲤MHC-DAB基因多态性及其与鱼体抗病力关系的分析 |
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| 引用本文： | 李雪松,刘至治,赵雪锦,马晓茜,冯维,王成辉. “全红”体色瓯江彩鲤MHC-DAB基因多态性及其与鱼体抗病力关系的分析[J]. 水产学报, 2011, 35(9): 1293-1301. DOI: 10.3724/SP.J.1231.2011.17488 |
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| 作者姓名： | 李雪松 刘至治 赵雪锦 马晓茜 冯维 王成辉 |
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| 作者单位： | 1. 上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室,上海,201306
2. 上海海洋大学农业部水产种质资源与利用重点开放实验室,上海,201306 |
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| 基金项目： | 上海市教育委员会科研创新基金(11YZ152);国家公益性行业科研专项(200903045);上海市水生生物学重点学科建设项目(S070301) |
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| 摘 要： | 利用一对特异性引物DABF和DABR,分别从21尾感病和16尾抗病“全红”体色瓯江彩鲤的cDNA中,扩增出长度为624 bp的MHC-DAB基因片段。共测序185个有效克隆,获得76个不同的核苷酸序列。MHC-DAB基因片段包括第1~4外显子,分别编码信号肽、β1和β2结构域及跨膜区。长度为276 bp的β1结构域有144个核苷酸变异位点(52.17%)和70个氨基酸变异位点(76.07%),而长度为282 bp的β2结构域只有98个核苷酸变异位点(34.75%)和50个氨基酸变异位点(53.19%),显示β1结构域的变异要明显大于β2结构域。在β1结构域的24个抗原结合位点(PBR)上,有23个发生了变异。β1结构域的PBR、非抗原结合位点(non-PBR)及β2结构域的ω值(ω=dN/dS)分别为1.367、0.886和0.754,表明“全红”体色瓯江彩鲤MHC-DAB基因(特别是β1结构域)在进化过程中受到正向选择作用。在所得的20个不同的等位基因中,基因DAB3*15在抗病群体中出现的频率(13.75%)显著高于感病群体中出现的频率(3.81%)(P<0.05);基因DAB3*09和DAB3*10的出现频率都为3.75%(P<0.05),仅存在于抗病群体中;而基因DAB3*02和DAB3*14的出现频率分别为7.62%(P<0.05)和8.57%(P<0.01),仅存在于感病群体中。
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| 关 键 词： | 瓯江彩鲤 主要组织相容性复合体 多态性 抗病力 |
| 收稿时间： | 2011-04-18 |
| 修稿时间： | 2011-05-27 |
Major histocompatibility complex DAB allele polymorphism and its association with resistance/susceptibility to Aeromonas hydrophila in whole redcolor patterns of Cyprinus carpio var. color |
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| LI Xue-song,LIU Zhi-zhi,ZHAO Xue-jin,MA Xiao-qian,FENG Wei and WANG Cheng-hui. Major histocompatibility complex DAB allele polymorphism and its association with resistance/susceptibility to Aeromonas hydrophila in whole redcolor patterns of Cyprinus carpio var. color[J]. Journal of Fisheries of China, 2011, 35(9): 1293-1301. DOI: 10.3724/SP.J.1231.2011.17488 |
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| Authors: | LI Xue-song LIU Zhi-zhi ZHAO Xue-jin MA Xiao-qian FENG Wei WANG Cheng-hui |
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| Affiliation: | Shanghai Ocean University,Shanghai Ocean University,Shanghai Ocean University,Shanghai Ocean University,Shanghai Ocean University,Shanghai Ocean University |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Cyprinus carpio var. color major histocompatibility complex polymorphism disease resistance |
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