| 我国部分苹果产区苹果锈果类病毒的检测和全序列分析 |
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| 引用本文： | 陈冉冉,谢吉鹏,叶婷,董云浩,国立耘,周涛.我国部分苹果产区苹果锈果类病毒的检测和全序列分析[J].植物保护,2017,43(6):97-102. |
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| 作者姓名： | 陈冉冉 谢吉鹏 叶婷 董云浩 国立耘 周涛 |
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| 作者单位： | 中国农业大学植物病理学系, 北京100193 |
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| 基金项目： | 国家现代农业(苹果)产业技术体系(nycytx-08-04-02); 国家公益性行业(农业)科研专项(201203076-02) |
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| 摘 要： | 近年来,由苹果锈果类病毒Apple scar skin viroid(ASSVd)引起的苹果花脸病、锈果病在我国一些苹果产区日趋严重,对我国苹果生产和苹果产业发展造成严重危害。为了解ASSVd在我国一些苹果产区的发生和变异情况,采用RT-PCR对陕西、山东、山西、河北、北京和黑龙江6个苹果产区的35份苹果样品进行检测,并克隆获得30个分离物的基因组全序列,大小为330~333个核苷酸。分析表明,这些分离物的基因组全序列与GenBank中ASSVd基因组核苷酸序列相似度为96%~100%,在苹果锈果类病毒属的末端保守区及中央保守区保守,在致病区和左端区域有突变,一些分离物的突变位点相同。系统发育分析表明分离物因相同的突变位点而聚类,而与地理来源无关。
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| 关 键 词： | 苹果 苹果锈果类病毒 RT-PCR 变异分析 系统发育 |
| 收稿时间： | 2016/11/22 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2017/1/20 0:00:00 |
Detection and full nucleotide sequences analysis of Apple scar skin viroid isolates in some apple producing areas of China |
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| Chen Ranran,Xie Jipeng,Ye Ting,Dong Yunhao,Guo Liyun,Zhou Tao.Detection and full nucleotide sequences analysis of Apple scar skin viroid isolates in some apple producing areas of China[J].Plant Protection,2017,43(6):97-102. |
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| Authors: | Chen Ranran Xie Jipeng Ye Ting Dong Yunhao Guo Liyun Zhou Tao |
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| Institution: | Department of Plant Pathology, China Agricultural University, Beijing 100193, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | apple Apple scar skin viroid RT-PCR variation analysis phylogenesis |
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