| 猪源牛病毒性腹泻病毒SH-28分离株的全基因组序列及遗传进化分析 |
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| 引用本文： | 陶洁,王银,廖金虎,杨颖,羊扬,朱国强.猪源牛病毒性腹泻病毒SH-28分离株的全基因组序列及遗传进化分析[J].中国兽医学报,2013,33(3):321-325. |
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| 作者姓名： | 陶洁 王银 廖金虎 杨颖 羊扬 朱国强 |
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| 作者单位： | 扬州大学兽医学院,江苏扬州,225009 |
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| 基金项目： | 江苏高校优势学科建设工程资助项目;教育部创新团队资助项目;江苏省农业支撑资助项目(BE2008363);江苏省属高校自然科学重大基础研究资助项目(08KJA230002);国家农业部“948”计划资助项目(201003012) |
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| 摘 要： | 为了解猪源牛病毒性腹泻病毒(BVDV)与牛源BVDV在遗传特性上的差异,本试验对实验室分离保存的1株猪源BVDV(SH-28)进行了全基因组测序.利用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)方法分段扩增了SH-28分离株的18条cDNA片段,分别克隆于pGEM-T质粒载体并进行测序,用CLUSTX(1.8)和Lasergene软件进行序列的剪切和拼接,最终获得SH-28基因组序列全长为12 279个核苷酸(nt),开放阅读框(ORF)长11 685 nt,编码3 895个氨基酸(aa),5'-UTR和3’-UTR分别长385 nt和206 nt.全基因组进化树结果表明,虽然SH-28与HLJ-10同处于一个分支上,但其与XJ-04的全基因组核苷酸同源性最高(92.3％),而与另外2株猪源BVDV-1(ZM-95、SD0806)的亲缘性较远(70.0％、70.1％).5’-UTR进化树结果显示,SH-28分离株属于BVDV-2a2基因亚型,而HLJ-10和J-04株属于BVDV-2a1.由此,我们推测SH-28很有可能是由牛源BVDV-2进化而来的,但不同于已发表的BVDV-2分离株.
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| 关 键 词： | 猪 BVDV 全基因组 同源性 |
Complete genomic sequencing and analysis of the pig bovine viral diarrhea virus strain SH-28 |
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| TAO Jie,WANG Yin,LIAO Jin-hu,YANG Ying,YANG Yang,ZHU Guo-qiang.Complete genomic sequencing and analysis of the pig bovine viral diarrhea virus strain SH-28[J].Chinese Journal of Veterinary Science,2013,33(3):321-325. |
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| Authors: | TAO Jie WANG Yin LIAO Jin-hu YANG Ying YANG Yang ZHU Guo-qiang |
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| Institution: | (College of Veterinary Medicine,Yangzhou University,Yangzhou,Jiangsu 225009,China) |
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