| 杯果木CCR基因克隆和同源进化分析 |
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| 引用本文： | 陈碧华.杯果木CCR基因克隆和同源进化分析[J].桉树科技,2009(1). |
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| 作者姓名： | 陈碧华 |
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| 作者单位： | 福建省林业科学研究院 |
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| 基金项目： | 澳大利亚研究协会科研项目(50412); 福建省科技厅青年人才项目(2007F3017) |
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| 摘 要： | 从粗毛杯果木和软叶杯果木基因组中克隆CCR基因,经测序验证扩增片断长度均为2321bp,包含部分外显子3、4和部分5,以及内含子3和4。同源性比较分析表明:粗毛杯果木与伞房属树种CCR的同源相似性达到98%～87%,与桉属树种CCR的同源相似性达到97%～84%;而软叶杯果木与伞房属树种CCR的同源相似性达到98%～87%,与桉属树种CCR的同源相似性达到95%～84%。总体上,该2个杯果木树种与伞房属CCR同源相似性较高,而与桉属CCR同源相似性较低。3个属中最长保守序列位于Exon5的第3147～3175位点,共29个碱基。保守区域主要集中于Exon5,少数于Intron4。桉属总变异率大于杯果木属和伞房属。桉属Exon4变异率大于属内其它Exon或Intron;同样发现Exon4的简约信息位点百分数大于属内其它Exon或Intron,但杯果木属中的Intron3变异率高于属内其它Exon或Intron。伞房属以Exon5的变异率最高。Exon或Intron平均变异率均以桉属最多,其次是杯果木属,最少的是伞房属。使用MEGA3.1软件构建的CCR进化树表明,桉属、伞房属和杯果木属分别形成单系,其亲缘关系可...
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| 关 键 词： | 粗毛杯果木 软叶杯果木 CCR基因 基因克隆 同源性 分子进化 |
Cloning and Phylogenetic Analysis of CCR Gene of Angophora spp. |
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| CHEN Bi-hua.Cloning and Phylogenetic Analysis of CCR Gene of Angophora spp.[J].Eucalypt Science & Technology,2009(1). |
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| Authors: | CHEN Bi-hua |
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| Institution: | CHEN Bi-hua(Fujian Academy of Forestry,Fuzhou 350012,Fujian,China) |
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| Abstract: | The CCR genes of Angophora hispida and Angophora subvelutina were cloned for sequencing.The sequence length of the two genes amplified were 2321 bp which comprised partial Exon 3,Exon 4 and partial Exon 5,as well as Intron 3 and 4.The results of BLAST for homology analysis showed A.hispida CCR genes had 98%～87% similarity with Corymbia ones,and 97%～84% similarity with Eucalyptus ones;but A.subvelutina had 98%～87% similarity with Corymbia ones,and 95%～84% similarity with Eucalyptus ones.In general,CCR of the... |
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| Keywords: | Angophora hispida(Sm )Blaxell Angophora subvelutina(F Muell )Brooker CCR gene gene cloning homology molecular evolution |
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