猪流行性腹泻病毒CH/GX/2015/750A株的分离鉴定及全基因组序列分析 |
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引用本文: | 秦毅斌,卢冰霞,何颖,段群棚,李斌,陈忠伟,梁家幸,周英宁,苏乾莲,蒋冬福,赵武.猪流行性腹泻病毒CH/GX/2015/750A株的分离鉴定及全基因组序列分析[J].中国畜牧兽医,2018(1). |
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作者姓名: | 秦毅斌 卢冰霞 何颖 段群棚 李斌 陈忠伟 梁家幸 周英宁 苏乾莲 蒋冬福 赵武 |
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作者单位: | 广西兽医研究所广西兽医生物技术重点实验室; |
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摘 要: | 本研究旨在获得可在细胞培养中稳定、有效生长增殖的猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)分离毒株,并对其全基因组序列进行测定分析。应用Vero细胞从广西腹泻仔猪肠道内容物中进行病毒分离,通过细胞病变和RT-PCR对细胞培养物进行鉴定,应用下一代测序技术对分离毒株全基因组序列进行测定。结果显示,成功分离到1株PEDV,命名为CH/GX/2015/750A。该毒株可稳定有效地在Vero细胞生长增殖,并引起典型的细胞病变;已在Vero细胞连续传代25代,病毒滴度随着传代次数的增加逐渐提高并稳定在107.50TCID50/mL。该毒株全基因组序列长28 038bp;与22个参考毒株的全基因序列比对显示,核苷酸同源性为96.8%~99.8%,其中与YC2014株同源性最高,为99.8%。全基因组和S基因系统进化分析显示,PEDV CH/GX/2015/750A分离毒株属于Ⅱa亚群,与YC2014、PEDV-WS等变异毒株亲缘关系密切。结果表明,本研究分离获得的CH/GX/2015/750A毒株是PEDV地方流行变异毒株。
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