| 大豆GmGLDH基因的克隆、表达及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 薛晨晨,徐筋燕,郭娜,赵晋铭,邢邯. 大豆GmGLDH基因的克隆、表达及生物信息学分析[J]. 分子植物育种, 2019, 17(6): 1738-1745 |
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| 作者姓名： | 薛晨晨 徐筋燕 郭娜 赵晋铭 邢邯 |
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| 作者单位： | 南京农业大学农学院,国家大豆改良中心,农业部大豆生物学与遗传育种重点实验室,作物遗传与种质创新国家重点实验室,南京,210095;南京农业大学农学院,国家大豆改良中心,农业部大豆生物学与遗传育种重点实验室,作物遗传与种质创新国家重点实验室,南京,210095;南京农业大学农学院,国家大豆改良中心,农业部大豆生物学与遗传育种重点实验室,作物遗传与种质创新国家重点实验室,南京,210095;南京农业大学农学院,国家大豆改良中心,农业部大豆生物学与遗传育种重点实验室,作物遗传与种质创新国家重点实验室,南京,210095;南京农业大学农学院,国家大豆改良中心,农业部大豆生物学与遗传育种重点实验室,作物遗传与种质创新国家重点实验室,南京,210095 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划;转基因生物新品种培育科技重大专项;大豆现代产业技术体系;江苏省现代作物生产协同创新中心;国家科技支撑计划 |
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| 摘 要： | 为了探究大豆L-半乳糖酸-1,4-内酯脱氢酶基因Gm GLDH-Glyma.02G166300 (以下简称GmGLDH)的功能,本研究采用同源克隆法获得大豆GmGLDH基因,开展了相关生物信息学分析,并对其非生物胁迫下表达模式进行调查。结果表明,GmGLDH基因包含一个长度为1 752 bp的ORF序列,编码584个氨基酸。GmGLDH蛋白为亲水性较强的蛋白;二级结构中以无规则卷曲和α螺旋结构为主;预测亚细胞定位GmGLDH主要分布在线粒体中,分析结果并未发现跨膜结构域和信号肽结构;该蛋白序列中存在磷酸化位点56个。进化分析表明,克隆的GmGLDH氨基酸序列与菜豆、苜蓿的同源关系较近。基因上游顺式调控元件分析表明该基因可能参与光应答、激素响应、高温响应等,但光处理下大豆子叶中Gm GLDH基因的表达变化不大,且和子叶中抗坏血酸含量无相关性;4种非生物胁迫处理下大豆叶片中Gm GLDH基因是先下调后上调表达,和抗坏血酸含量变化呈反相关。本研究为进一步研究GmGLDH基因在大豆抗逆中的作用提供了重要的帮助。
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| 关 键 词： | 大豆 L-半乳糖酸-1,4-内酯脱氢酶基因 非生物胁迫 表达 生物信息学分析 |
Cloning,Expression and Bioinformatics Analysis of GmGLDH Gene in Soybean |
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| Xue Chenchen,Xu Jinyan,Guo Na,Zhao Jinming,Xing Han. Cloning,Expression and Bioinformatics Analysis of GmGLDH Gene in Soybean[J]. Molecular Plant Breeding, 2019, 17(6): 1738-1745 |
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| Authors: | Xue Chenchen Xu Jinyan Guo Na Zhao Jinming Xing Han |
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| Affiliation: | (Key Laboratory of Biology and Genetics and Breeding for Soybean,State Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement,Ministry ofAgriculture,National Center for Soybean Improvement,Nanjing Agricultural University,Nanjing,210095) |
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| Abstract: | Xue Chenchen;Xu Jinyan;Guo Na;Zhao Jinming;Xing Han(Key Laboratory of Biology and Genetics and Breeding for Soybean,State Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement,Ministry ofAgriculture,National Center for Soybean Improvement,Nanjing Agricultural University,Nanjing,210095) |
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| Keywords: | Soybean L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase gene Abiotic stress Expression Bioinformatics analysis |
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