| 大薯ERF基因家族的挖掘与特征 |
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| 引用本文： | 张金兰,张博,黄东益,肖勇,吴文嫱,许云,黄小龙,夏薇.大薯ERF基因家族的挖掘与特征[J].分子植物育种,2019,17(7):2086-2093. |
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| 作者姓名： | 张金兰 张博 黄东益 肖勇 吴文嫱 许云 黄小龙 夏薇 |
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| 作者单位： | 海南大学热带农林学院,海口,570100;中国热带农业科学院椰子研究所,文昌,571300 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金;国家自然科学基金 |
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| 摘 要： | 大薯属于薯蓣科薯蓣属,是热带和亚热带地区的一种重要的粮食作物,但其基础研究还较为薄弱。本研究基于公布的大薯转录谱序列和基因组序列,开展了对大薯ERF家族基因的挖掘和特征分析。共找到DaERF基因41个,其中14个DaERF有一个以上的外显子,其余的均为一个外显子。进一步的blastx分析发现30个DaERF基因具有保守的AP2结构域,依据AP2序列构建系统进化树,可将其分成5个亚家族。通过对AP2结构域的两个保守motif的位置和结合位点的分析,发现相同家族的ERF蛋白具有相似的结构特征。根据大薯转录谱分析DaERF在不同组织中的表达,发现一些DaERF的表达具有组织特异性,并且属于同一亚家族基因的表达具有相似性。我们对在块茎中具有高表达的DaERF-DaERF24基因,使用RT-qPCR验证其在不同组织的表达,结果与转录谱数据一致。本研究通过对大薯ERF转录因子家族特性的初步挖掘,为以后研究ERF家族全基因分布、ERF基因功能验证和薯块生长发育机理提供依据。
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| 关 键 词： | 大薯(Dioscorea alata L.) ERF 基因家族 |
Identification and Characterization of ERF Gene Family in Great Yam(Dioscorea alata L.) |
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| Zhang Jinlan,Zhang Bo,Huang Dongyi,Xiao Yong,Wu Wenqiang,Xu Yun,Huang Xiaolong,Xia Wei.Identification and Characterization of ERF Gene Family in Great Yam(Dioscorea alata L.)[J].Molecular Plant Breeding,2019,17(7):2086-2093. |
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| Authors: | Zhang Jinlan Zhang Bo Huang Dongyi Xiao Yong Wu Wenqiang Xu Yun Huang Xiaolong Xia Wei |
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| Institution: | (Hainan University Institute of Tropical Agriculture and Forestry, Haikou, 570100;Coconut Research Institute, Wenchang, 571300) |
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| Abstract: | Zhang Jinlan;Zhang Bo;Huang Dongyi;Xiao Yong;Wu Wenqiang;Xu Yun;Huang Xiaolong;Xia Wei(Hainan University Institute of Tropical Agriculture and Forestry, Haikou, 570100;Coconut Research Institute, Wenchang, 571300) |
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| Keywords: | Dioscorea alata L ERF Gene family |
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