首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
     检索      

基于RNA-seq筛选白藜芦醇致猪卵巢颗粒细胞凋亡的可变剪接基因
引用本文:章会斌,韩政,刘阳光,周忍,陈一歌,许黎明,徐启隆,殷宗俊,张晓东.基于RNA-seq筛选白藜芦醇致猪卵巢颗粒细胞凋亡的可变剪接基因[J].中国畜牧杂志,2022(8):36-44.
作者姓名:章会斌  韩政  刘阳光  周忍  陈一歌  许黎明  徐启隆  殷宗俊  张晓东
作者单位:1. 安徽农业大学动物科技学院;2. 地方畜禽遗传资源保护与生物育种安徽省重点实验室
基金项目:国家自然科学基金(31972531);;国家重点研发计划(2021YFD1301200);
摘    要:本研究旨在探究参与白藜芦醇(Resveratrol,RES)诱导猪卵巢颗粒细胞(Porcine Ovarian Granulosa Cells,pGCs)凋亡的可变剪接基因。实验以50、100μmol/LRES处理pGCs,并设置空白对照,利用转录组测序(RNA-seq)技术分析3组之间差异可变剪接基因的表达谱,对差异可变剪接基因进行GO和KEGG富集分析,通过qRT-PCR验证RNA-seq数据。结果表明,与对照组相比,低浓度组有198种基因参与了236个可变剪接事件,高浓度组有603种基因发生了779个可变剪接事件。在log2|FoldChange|>1、P<0.05条件下,分别在低浓度组筛选到6个、高浓度组筛选到35个差异可变剪接基因。GO分析显示,差异可变剪接基因主要参与生物学过程条目。KEGG分析发现,显著富集的通路均与激素分泌及代谢途径相关,如卵巢类固醇生成信号通路、氨基酸代谢相关信号通路等。进一步从中筛选出可能参与RES诱导pGCs凋亡的关键基因(AKR1C1、GLUL、SARDH、MADD基因)。综上,RES通过影响pGCs中基因的可变剪接,从而影响相关信号...

关 键 词:白藜芦醇  颗粒细胞  转录组测序  可变剪接  
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号