苏博美利奴羊毛囊发育不同时期ncRNA调控网络的构建 |
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引用本文: | 张小伟,何军敏,徐新明,田月珍,关鸣轩,张漫,付雪峰,哈尼克孜·吐拉甫,黄锡霞,田可川.苏博美利奴羊毛囊发育不同时期ncRNA调控网络的构建[J].中国畜牧杂志,2022(7):122-133. |
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作者姓名: | 张小伟 何军敏 徐新明 田月珍 关鸣轩 张漫 付雪峰 哈尼克孜·吐拉甫 黄锡霞 田可川 |
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作者单位: | 1. 新疆农业大学动物科学学院;2. 新疆畜牧科学院畜牧研究所;3. 山东省农业科学院畜牧兽医研究所 |
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基金项目: | 国家现代农业产业技术体系建设项目(CARS-40);;国家自然科学基金(31760655); |
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摘 要: | 为探索苏博美利奴羊毛囊发育相关ncRNA分子调控网络,本研究通过挖掘苏博美利奴羊皮肤组织样本不同时期转录组数据,利用生物信息学方法构建lncRNA-miRNA-mRNA分子调控网络。结果表明:不同时期mRNA与lncRNA及miRNA具有复杂的网络连接。通过GO富集分析发现靶基因主要参与细胞增殖调控、凋亡过程及毛囊形态发生等生物学过程;参与细胞外空间、细胞外泌体、转录因子复合体、质膜的整体成分等细胞组分;参与转录因子活性、结构分子活性、细胞外基质结构组成等分子功能。通过KEGG通路分析发现差异的靶基因主要参与TGF-beta信号通路、癌症途径、MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路、细胞因子与细胞因子受体的相互作用等多种途径。筛选寻找调控网络中的关键基因,发现G2 vs.G1组中miR-133、miR-433-5p的靶基因TGFβ2和NOTCH1参与毛囊形态发生(GO:0031069)的生物学过程,因此TGFβ2和NOTCH1为毛囊发育的关键基因。通过构建苏博美利奴羊毛囊发育相关ncRNA分子调控网络,解析毛囊发生发育的分子调控机制,从转录组学层面对毛囊生长发育进行探讨,能够对苏博...
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关 键 词: | miRNA lncRNA mRNA 毛囊发育 调控网络 苏博美利奴羊 |
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