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番茄LemiR390及其预测靶基因LeTAS3的鉴定与表达分析
引用本文:于丽丽,刘伟伟,方媛,周莹,王如意,李洋,周波.番茄LemiR390及其预测靶基因LeTAS3的鉴定与表达分析[J].园艺学报,2015,42(2):271-279.
作者姓名:于丽丽  刘伟伟  方媛  周莹  王如意  李洋  周波
作者单位:东北林业大学生命科学学院,哈尔滨 150040
基金项目:东北林业大学国家基础科学人才培养基金项目(201220A5);国家自然科学基金项目(30800082,31272200);中央高校基本科研业务费专项资金项目(DL11CA03,2572014EA03-02)
摘    要:以番茄(Lycopersicon esculentum)紫色花青素积累品系Aft基因型‘LA1996’为试验材料,以番茄总RNA反转录的cDNA文库为模板,根据mirbase数据库中MIR390基因和番茄unigene数据库预测到的靶基因序列,克隆番茄LemiR390前体基因及其预测靶基因LeTAS3;采用定量PCR技术检测LemiR390及其预测靶基因LeTAS3在番茄果实不同发育阶段的表达情况,利用RLM 5′RACE技术验证LemiR390对靶基因mRNA的剪切作用。结果表明,克隆到两个LemiR390的前体,分别与MIR390a和MIR390b一致,含有完整的茎环结构。LemiR390与其靶基因LeTAS3在番茄果实不同发育时期表达量不同,果实发育前期特别是花后1 ~ 2周幼果期表达量高,发育后期均下降为微量表达,并且在幼果期LemiR390与LeTAS3表达呈负调控关系。LemiR390能够靶作用于LeTAS3的转录本调控其降解,其剪切位点为LemiR390序列5′端的第10位碱基。

关 键 词:番茄  LemiR390  LeTAS3  基因表达  miRNA  

Identification and Expression Character Analysis of LemiR390 and Its Potential Target LeTAS3 in Tomato
YU Li-li,LIU Wei-wei,FANG Yuan,ZHOU Ying,WANG Ru-yi,LI Yang,ZHOU Bo.Identification and Expression Character Analysis of LemiR390 and Its Potential Target LeTAS3 in Tomato[J].Acta Horticulturae Sinica,2015,42(2):271-279.
Authors:YU Li-li  LIU Wei-wei  FANG Yuan  ZHOU Ying  WANG Ru-yi  LI Yang  ZHOU Bo
Institution:College of Life Science,Northeast Forestry University,Harbin 150040,China
Abstract:
Keywords:tomato  LemiR390  LeTAS3  gene expression  miRNA
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