| 牙鲆微卫星标记遗传连锁图谱的构建 |
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| 引用本文： | 宋文涛,张潇峮,廖小林,邵长伟,王磊,庞仁谊,牛余泽,赵永伟,李文龙,梁卓,田永胜,陈松林.牙鲆微卫星标记遗传连锁图谱的构建[J].农业生物技术学报,2011(6). |
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| 作者姓名： | 宋文涛 张潇峮 廖小林 邵长伟 王磊 庞仁谊 牛余泽 赵永伟 李文龙 梁卓 田永胜 陈松林 |
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| 作者单位： | 中国水产科学研究院黄海水产研究所农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室;上海海洋大学水产与生命学院;华中农业大学水产学院;中国海洋大学生命学院;大连水产学院生命科学与技术学院;青岛农业大学动物科技学院; |
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| 基金项目： | 公益性行业(农业)科研专项(No.200903046); 国家基础研究发展规划(973)项目(No.2010CB126303); 国家自然科学基金项目(No.30871918); 山东省泰山学者工程专项共同资助 |
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| 摘 要： | 为了实现分子标记或基因辅助育种在牙鲆养殖中成功运用,并快速提高牙鲆产量,使用微卫星标记首次构建了国内第一张牙鲆遗传连锁图谱。采用基因组测序的方法,筛选出大量微卫星序列,从中随机挑选1 000条序列设计合成引物,利用2009年建立的第10号家系为作图群体,使用JoinMap4.0软件,构建了牙鲆(Paralichthys olivaceus)SSR标记遗传连锁图谱。雌雄图谱分别由24个连锁群组成,其中雌性图谱标记212个,总长度1 320.4 cM,覆盖率为77.7%;雄性图谱标记198个,总长度1 361 cM,覆盖率为76.1%。每个连锁群长度变动在9.3～116.1 cM之间,连锁群上的标记数在3～21个之间。各连锁群上的SSR标记并不是均匀分布的,其中1、3和8号连锁群存在标记密集区。该图谱能够进行初步的QTL定位分析和基因定位相关研究,为开展牙鲆基因和QTL的精细定位及分子标记辅助育种(MAS)等提供更有效的依据。
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| 关 键 词： | 牙鲆 遗传连锁图谱 微卫星 分子标记辅助育种 |
Construction of a Microsatellite-based Genetic Linkage Map in Japanese flounder(Paralichthys olivaceus) |
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| Institution: | Song Wentao1,2 Zhang Xiaoqun1,3 Liao Xiaolin1 Shao Changwei1 Wang Lei1,4 Pang Renyi1,5 Niu Yuze1,2 Zhao Yongwei1,6 Li Wenlong1,2 Liang Zhuo1,2 Tian Yongsheng1 Chen Songlin1* 1 Key Laboratory for Sustainable Utilization of Marine Fisheries Resources,Ministry of Agriculture,Yellow Sea Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences,Qingdao 266071,China,2 College of Fisheries and Life Sciences,Shanghai Ocean University,Shanghai 201306,3 College of Fisheries,Huazhong Agricultural Universi... |
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| Abstract: | For carrying out molecular marker or gene assistant selective breeding in Japanese flounder cultivation,and increasing commercial production of Japanese flounder,we used simple sequence repeat(SSR) markers to construct the primary linkage map in a family of Japanese flounder in China.One thousand novel microsatellite markers for Japanese flounder(Paralichthys olivaceus) were selected randomly from a microsatellite-enriched library constructed by genome sequencing for designing primers.The genetic linkage ma... |
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| Keywords: | Paralichthys olivaceus Genetic linkage map Simple sequence repeat(SSR) Marker assisted selection |
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