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转录组测序在林草植物抗逆性研究中的应用
引用本文:高慧娟,吕昕培,王润娟,任伟,程济南,汪永平,邵坤仲,张金林.转录组测序在林草植物抗逆性研究中的应用[J].草业学报,2019,28(12):184-196.
作者姓名:高慧娟  吕昕培  王润娟  任伟  程济南  汪永平  邵坤仲  张金林
作者单位:兰州大学农业农村部草牧业创新重点实验室,兰州大学草地农业生态系统国家重点实验室,兰州大学草地农业科技学院,甘肃 兰州 730020,甘肃 兰州 730020
基金项目:甘肃省科技支撑计划项目(1604NKCA077)资助
摘    要:生物和非生物胁迫对农作物产量和生态环境造成极大的威胁,林草植物对外界环境具有较强的适应能力,因此挖掘林草植物抗逆基因,分析其抗逆机制已经成为当下的研究趋势。随着科学技术的发展,利用生物测序技术研究植物抗逆的分子机制已成为当今植物逆境生理和分子生物学研究的一个重大课题,其中转录组测序(RNA-seq)研究是揭示植物抗逆机理以及筛选抗逆基因的主要研究技术。以Roche/454、Illumina/Solexa和ABI/SOLID为代表的二代测序技术(NGS)发展迅速,相较于传统测序手段具有成本低、测序时间短、高通量等优点,已被广泛应用于全基因组、RNA-seq和miRNA测序等研究。因此,RNA-seq技术可加快林草植物抗逆机制的研究和抗逆基因资源的挖掘,从而为农作物、优良林草植物抗逆性遗传改良和新品种培育奠定基础。本研究详细介绍了近年来NGS技术在林草植物应对病虫害、高温、冷害、盐、干旱以及土地贫瘠等方面的转录组学的研究进展,最后针对转录组测序的发展趋势和应用前景进行了展望。

关 键 词:RNA-seq  生物胁迫  非生物胁迫  抗逆性
收稿时间:2019-08-06

Application of RNA-seq technology in research on herb,shrub and tree stress resistance
GAO Hui-juan,LÜ,Xin-pei,WANG Run-juan,REN Wei,CHENG Ji-nan,WANG Yong-ping,SHAO Kun-zhong,ZHANG Jin-lin.Application of RNA-seq technology in research on herb,shrub and tree stress resistance[J].Acta Prataculturae Sinica,2019,28(12):184-196.
Authors:GAO Hui-juan    Xin-pei  WANG Run-juan  REN Wei  CHENG Ji-nan  WANG Yong-ping  SHAO Kun-zhong  ZHANG Jin-lin
Institution:Key Laboratory of Grassland Livestock Industry Innovation, Ministry of Agriculture, State Key Laboratory of Grassland Agro-Ecosystem, College of Pastoral Agriculture Science and Technology, Lanzhou University, Lanzhou 730020, China
Abstract:
Keywords:RNA-seq  biotic stress  abiotic stress  plant stress resistance  
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