| 8株分离自四川、贵州地区猪繁殖与呼吸综合征病毒毒株的全基因组特征分析 |
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| 作者姓名： | 周泷 康润敏 张毅 谢波 于吉锋 李春 张斌 汤承 王红宁 |
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| 作者单位： | 1. 西南民族大学生命科学与技术学院, 成都 610041;2. 四川省畜牧科学研究院, 成都 610066;3. 四川省动物疫病预防控制中心, 成都 610041;4. 成都正大农牧食品有限公司, 成都 610081;5. 四川大学生命科学学院, 成都 610064 |
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| 基金项目： | 四川省科技计划项目（2016NZ0006）;四川省科技计划项目（2016NYZ0042）;四川省财政运行专项（SASA2014CZYX009）;国家现代农业体系四川创新团队建设（Sccxtd-004）;四川省应用基础项目（2019YJ0561）;四川省科技计划重点研发项目（2018NZ0130） |
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| 摘 要： | 本研究旨在了解近年来我国四川、贵州地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的分子流行病学及遗传变异情况,对该地区2016—2018年间采集的8份PRRSV阳性样品进行病毒分离鉴定和全基因组测序,进一步使用RDP4和Simplot生物软件对全基因序列进行重组分析。结果显示,8个PRRSV毒株全基组全长为15 010～15 321 nt,毒株间相似性为80.9%～91.7%。NSP2氨基酸分析结果显示,4个毒株表现出与HP-PRRSV毒株一致的30 aa缺失,另外4株表现出与NADC30毒株一致的131 aa缺失。其中,GZgy17表现为"1+19+29 aa"新型缺失模式。ORF5氨基酸分析显示,3个毒株在33位点出现新型的1 aa缺失。遗传重组分析显示,8个毒株表现出PRRSV-2毒株6种不同谱系(Lineage)间的重组方式,分别如下:1) SCnj16:L8+L1; 2) SCxyz17:L1+L5; 3) SCya18:L1+L3; 4) GZgy17:L8+L3; 5) SCcd17和SCN17:L1+L8+L5; 6) SCcd16和SCya17:L1+L8+L3。本研究结果表明,我国四川、贵州地区不仅有多种谱系PRRSV毒株并存,其基因组还出现了复杂的遗传重组现象,具有上述复杂基因组的PRRSV毒株在我国的流行状况值得高度关注。
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| 关 键 词： | 猪繁殖与呼吸综合征病毒 病毒分离鉴定 全基因组 缺失 重组 |
| 收稿时间： | 2019-11-25 |
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