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羊栖菜硫酸多糖诱导下的人红白血病HEL细胞差异表达基因分析
引用本文:丁浩淼,杜昊霏,付瑞洁,金旭东,谢策,陈彤妮,汪财生,钱国英.羊栖菜硫酸多糖诱导下的人红白血病HEL细胞差异表达基因分析[J].核农学报,2021,35(3):595-604.
作者姓名:丁浩淼  杜昊霏  付瑞洁  金旭东  谢策  陈彤妮  汪财生  钱国英
作者单位:浙江万里学院生物与环境学院,浙江宁波315100;浙江万里学院生物与环境学院,浙江宁波315100;浙江万里学院生物与环境学院,浙江宁波315100;浙江万里学院生物与环境学院,浙江宁波315100;浙江万里学院生物与环境学院,浙江宁波315100;浙江万里学院生物与环境学院,浙江宁波315100;浙江万里学院生物与环境学院,浙江宁波315100;浙江万里学院生物与环境学院,浙江宁波315100
基金项目:宁波市“十三五”海洋经济创新发展示范项目资助(NBHY-2017-S5、 NBHY-2017(1)),宁波市高校食品科学与工程重点学科资助(2020FSEKDNB001),浙江省“生物工程”一流学科资助(ZS2020011)
摘    要:为探讨人红白血病HEL细胞经羊栖菜硫酸多糖(SFPS Ⅱ)处理后基因表达谱的变化,本研究用SFPS Ⅱ作用HEL细胞24 h,应用转录组技术筛选差异表达基因,分析差异基因富集的GO功能和KEGG信号通路,并通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)对部分差异表达基因进行验证。结果表明,SFPS Ⅱ处理HEL细胞后,HEL细胞活力降低,呈浓度依赖性,但对正常人胚肺成纤维细胞MRC-5几乎无毒性。与对照组相比,共有1 248个基因差异表达,其中219个上调,1 029个下调。GO分析显示,差异表达基因主要改变DNA构象、硫酸盐转运及对肿瘤坏死因子和外在凋亡信号反应等生物学功能。KEGG信号通路分析显示,显著富集的通路与Rap 1信号通路等癌症和免疫密切相关。试验随机选择16个显著差异基因,并通过RT-qPCR进行确认,发现SFPS Ⅱ诱导HEL细胞后,导致表达差异基因与肿瘤生物学进程和通路显著相关。本研究结果为揭示羊栖菜硫酸多糖抗肿瘤机制的提供了理论依据。

关 键 词:羊栖菜  硫酸多糖  人红白血病  转录组  差异表达基因
收稿时间:2019-11-08

Analysis of Differentially Expresses Genes in Human Erythroleukemia Cells Induced by Sulfated Polysaccharide Fraction From Sargassum fusiforme
DING Haomiao,DU Haofei,FU Ruijie,JIN Xudong,XIE Ce,CHEN Tongni,WANG Caisheng,QIAN Guoying.Analysis of Differentially Expresses Genes in Human Erythroleukemia Cells Induced by Sulfated Polysaccharide Fraction From Sargassum fusiforme[J].Acta Agriculturae Nucleatae Sinica,2021,35(3):595-604.
Authors:DING Haomiao  DU Haofei  FU Ruijie  JIN Xudong  XIE Ce  CHEN Tongni  WANG Caisheng  QIAN Guoying
Institution:College of Biological and Environmental Sciences, Zhejiang Wanli University, Ningbo, Zhejiang 315100
Abstract:
Keywords:
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