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绿鳍马面鲀雌雄性腺转录组比较分析
作者姓名:吴丹  陈四清  柯翎  张子阳  朱金超  潘鲁莹  李凤辉  徐荣静  彭立成  边力
作者单位:1.上海海洋大学水产与生命学院 上海 201306;海水养殖生物育种与可持续产出全国重点实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所 山东 青岛 266071;2.海水养殖生物育种与可持续产出全国重点实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所 山东 青岛 266071;3.福建省农业科学院生物技术研究所 福建 福州 350003;4.烟台开发区天源水产有限公司 山东 烟台 264001;5.宁德市南海水产科技有限公司 福建 宁德 352102
基金项目:中国水产科学研究院黄海水产研究所基本科研业务费 ( 20603022022014 );烟台市科技创新发展计划 ( 2022XCZX078 );山东省重点研发计划住鲁院士团队支持项目 ( 2023ZLYS02 );福建省公益类竞争性项目 ( 2023R1082 );福建省区域发展项目 ( 2022N3015 )
摘    要:为探明绿鳍马面鲀(Thamnaconus septentrionalis)性腺发育相关基因表达特征,优化亲本生殖调控技术,本研究对绿鳍马面鲀雌雄亲体的精巢和卵巢进行了转录组测序分析,经de novo拼装,最终获得 119 219 个单基因(unigene),N50 长度为1 255 bp.在NR、NT、KO、SwissProt、PFAM、GO及KOG数据库分别注释到 24 009、35 057、18 453、26 971、30 294、11 420 和21 613个unigene.绿鳍马面鲀精巢和卵巢转录组中存在 18 954 个差异表达基因(DEG),相对于精巢,在卵巢中上调表达的基因有 11 265 个,下调表达的有 7 689 个.选取bmp2、sox3、figla、hsd17b1、cyp19a、cyp17、foxl2、star和amh 9 个DEGs进行实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证,结果显示,qRT-PCR结果与RNA-Seq分析相一致.GO和KEGG富集结果分析发现,amh、cyp17 和star可能在绿鳍马面鲀雄性精子发生过程中起关键作用;bmp2、foxl2、cyp19a、figla和hsd17b1 在雌性卵子发生和卵巢类固醇生成过程中发挥重要作用.本研究通过比较绿鳍马面鲀精巢和卵巢的转录组表达差异,初步阐明了精巢和卵巢的基因表达特征,为进一步研究绿鳍马面鲀的性腺发育机制奠定了基础.

关 键 词:绿鳍马面鲀  转录组  性腺  差异表达基因
收稿时间:2023-04-26
修稿时间:2023-05-22
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