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不同产地太子参芜菁花叶病毒CP基因的分离与序列差异性分析
引用本文:匡云波,叶炜,李金辉,于静静,叶祖云,赖钟雄.不同产地太子参芜菁花叶病毒CP基因的分离与序列差异性分析[J].热带作物学报,2016,37(10):1974-1979.
作者姓名:匡云波  叶炜  李金辉  于静静  叶祖云  赖钟雄
作者单位:1. 宁德师范学院生物系,福建宁德352100;福建省特色药用植物工程技术研究中心,福建宁德352100;2. 三明市农业科学研究院药用植物研究所,福建三明,365000;3. 宁德师范学院生物系,福建宁德,352100;4. 福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福建福州,350002
基金项目:福建省教育厅科技项目(No. JA15563);福建省种业创新与产业化工程项目(No. 2014S1477-12);宁德师范学院引进人才项目(No. 2014Y004)。
摘    要:通过对不同产地的8份太子参病叶样品进行芜菁花叶病毒(Turnip mosaic virus,Tu MV)外壳蛋白(coat protein,CP)基因的RT-PCR检测,从其中7份样品中扩增得到特异性目的条带,对所获得的13个克隆子序列进行下一步的序列分析。结果显示:所得CP基因序列均为775 bp,存在36个核苷酸多态性位点,总变异数为37个,部分点突变仅在某产地发现,可能存在重组;各地分离物之间的遗传分化程度高,遗传漂变可能是造成遗传分化的主要原因;在系统进化树分析结果中,太子参Tu MV CP序列均聚类在World B组,并呈现一定的地域特异性。本研究为建立更有效的太子参Tu MV检测方法和针对性制定病毒病防控策略奠定重要基础。

关 键 词:太子参  TuMV  CP  RT-PCR  序列差异性分析

Cloning and Sequence Difference Analysis of Coat Protein Genes of Turnip mosaic virus Isolates from Pseudostellaria heterophylla
KUANG Yunbo,YE Wei,LI Jinhui,YU Jingjing,YE Zuyun and LAI Zhongxiong.Cloning and Sequence Difference Analysis of Coat Protein Genes of Turnip mosaic virus Isolates from Pseudostellaria heterophylla[J].Chinese Journal of Tropical Crops,2016,37(10):1974-1979.
Authors:KUANG Yunbo  YE Wei  LI Jinhui  YU Jingjing  YE Zuyun and LAI Zhongxiong
Institution:1 Biology Department, Ningde Normal University 2 Engineering and Technology Research Center of Medical Plants with Fujian Provincial Characteristics;Institute of Medicinal Plant, Sanming Academy of Agricultural Sciences;Biology Department, Ningde Normal University;Biology Department, Ningde Normal University;1 Biology Department, Ningde Normal University 2 Engineering and Technology Research Center of Medical Plants with Fujian Provincial Characteristics;Institute of Horticultural Biotechnology, Fujian Agriculture and Forestry University
Abstract:
Keywords:Pseudostellaria heterophylla  TuMV  CP  RT-PCR  Sequence difference analysis
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