薄壳山核桃MADS-box基因保守片段的克隆与序列分析 |
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引用本文: | 莫正海,张计育,翟,敏,贾晓东,宣继萍,李永荣,郭忠仁.薄壳山核桃MADS-box基因保守片段的克隆与序列分析[J].南方农业学报,2012,44(5):730-734. |
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作者姓名: | 莫正海 张计育 翟 敏 贾晓东 宣继萍 李永荣 郭忠仁 |
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作者单位: | (1 中国科学院植物研究所 南京 210014 2 南京绿宙薄壳山核桃科技有限公司 南京 210072) |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31200502);江苏省科技支撑计划项目(BE2012338);江苏省农业科技自主创新资金项目[CX(12)2012];南京市科技计划项目(201101025) |
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摘 要: | 【目的】克隆薄壳山核桃MADS-box基因的保守片段,进行系统发育分析,为研究薄壳山核桃花发育相关MADS-box家族基因及其发育的分子机理奠定基础。【方法】以薄壳山核桃品种‘马罕’雄花花序为材料,提取总RNA反转录cDNA,采用RT-PCR克隆MADS-box基因的保守片段,并将其推导氨基酸序列与已知拟南芥的MADS-box家族基因进行系统发育分析。【结果】分离获得28条MADS-box基因的cDNA片段,片段长度均为137 bp,包含基因起始密码子,核苷酸序列同源性为65.7%~98.5%,其推导氨基酸序列中有11个存在差异。系统发育树分析结果表明,这些基因片段分别归入拟南芥MADS-box基因不同亚家族中,包含ABCDE模型中的各类基因。【结论】薄壳山核桃中存在多种MADS-box家族基因,克隆的片段包含ABCDE模型中的各类花发育基因。
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关 键 词: | 薄壳山核桃 MADS-box基因 RT-PCR 克隆 序列分析 |
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