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基于SSR标记的海南54份榴莲种质资源遗传多样性和群体结构分析
引用本文:邓会栋,乔阳,郭利军,华敏,谢圣华,冀晓昊,吴晓慧,冯学杰,王海波.基于SSR标记的海南54份榴莲种质资源遗传多样性和群体结构分析[J].中国果树,2023(12):90-98+2.
作者姓名:邓会栋  乔阳  郭利军  华敏  谢圣华  冀晓昊  吴晓慧  冯学杰  王海波
作者单位:1. 海南省农业科学院热带果树研究所,农业农村部热带果蔬遗传资源评价利用重点实验室,农业农村部海口热带果树科学观测实验站,海南省热带果树生物学重点实验室,海南省热带果树育种工程技术研究中心;2. 中国农业科学院果树研究所
摘    要:对海南省引种种植的54份榴莲种质资源采用荧光SSR分子标记技术,进行SSR多态性分析、聚类分析、群体结构分析、遗传多样性分析。结果表明,筛选获得19对多态性较高的SSR引物,通过DNA扩增共检测出117个多态性等位基因,平均多态性等位基因数为6.158个,平均有效等位基因数为3.398个,香农指数平均值为1.372,观察杂合度和期望杂合度的平均值均为0.689,多态信息指数平均值为0.643,表明具有一定的遗传多样性。基于UPGMA方法进行聚类分析,在遗传距离0.6处54份榴莲种质资源可以分成3个类群,第一类群共45份种质资源,包括引种于不同国家的不同榴莲品种;第二类群共8份种质资源,均为引种于不同国家的猫山王榴莲;第三类群共1份种质资源,是引种于泰国的红榴莲。以遗传距离0.3为阈值,第一类群又可以分为9个亚群。基于Structure可以将54份榴莲种质资源划分为5个亚群。综合聚类和群体结构分析,明确了部分未知种质资源的品种所属,对不同亚群的遗传变异、遗传距离和遗传分化分析发现,个体的变异是总变异的主要来源,亚群5与其他亚群的遗传距离和遗传分化程度最大,不同亚群整体基因流较大,遗传分化...

关 键 词:榴莲种质资源  荧光SSR标记  聚类分析  群体结构  遗传多样性  遗传分化
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